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修饰蛋白定量分析 • N-糖基化蛋白质组学

 

· 产品定义

糖基化是指蛋白质在酶的作用下将糖链连接到蛋白质特定氨基酸形成糖苷键的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都有一个或多个糖链。连接于天冬酰胺(Asn)残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在,也是研究最为深入的一种糖基化形式。N-糖基化具有重要的生物学功能,在细胞核内调节转录和信号传导;在细胞内可作为营养感受器;在分泌途径中,内质网启动的糖基化类型参与蛋白质折叠、稳定和运输;在细胞表面,调节蛋白稳定性或活性、提供细胞粘附的接触点,调节受体的配体特异性或亲和力、调节受体二聚化和信号传导;在细胞-细胞粘附和通讯中起作用;介导细菌宿主相互作用,如初始附着和入侵、定植。

N-糖基化蛋白质组首先对蛋白质进行酶解,随后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,再用N-糖酰胺酶(PNGase)在重水中切除糖链,发生N-糖基化的天冬酰胺残基分子量增加2.989Da,利用质谱可测定分子量是否发生对应的质量偏移,从而检测N糖基化修饰及位点。

 

· 技术路线

 N-糖基化蛋白质组

                 

· 技术优势

1. 关注度持续攀升的糖基化修饰,研究潜力巨大

2. 凝集素+重水切糖,排除糖链干扰,特异性检测N-糖基化位点

3. 助力客户发表多篇文章

 

· 数据分析

标准数据分析内容

鉴定分析

鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图

表达差异分析

差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图;

功能分析

亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析

功能分析

GSEA富集分析

临床药物研究

药物靶点注释

标志物筛选

集成机器学习

与临床表征的联合分析

ROC分析;WGCNA分析

关于个性化数据分析需求,请来电咨询

 

· 推荐应用领域

1. 信号转导研究

2. 基因表达调控研究

3. 肿瘤发展机制研究

 

· 送样建议

 样品类型

推荐送样量

动物组织类

常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等)

30mg

植物组织类

柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等)

100mg

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

1.5×10^7

体液类

血清/血浆

150μL

脑脊液、关节液、淋巴液、附睾腔液

100μL

 

· 应用案例

    1.Protein Nglycosylation aberrations and glycoproteomic network alterations in osteoarthritis and osteoarthritis with type 2 diabetes. 2022. Scientific Reports (IF 4.6 )

骨关节炎和伴2型糖尿病骨关节炎中的蛋白N糖基化畸变和糖蛋白组网络改变

       2. Quantitative proteomics analysis reveals important roles of N-glycosylation on ER quality control system for development and pathogenesis in Magnaporthe oryzae. 2020. PLoS Pathogens. (IF 6.7)

N糖基化蛋白质组修饰揭示N糖基化修饰参与稻瘟菌致病过程的分子机制