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翻译后修饰—修饰蛋白定量分析

定量甲基化蛋白质组学 (Methylation)

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蛋白质甲基化修饰(Methylation)是表观遗传学的重要研究内容之一。甲基化多发生在转录因子和核蛋白质上,也有少量胞质蛋白会发生。甲基化可发生在精氨酸(R)和赖氨酸(K)上,包括单甲基化、非对称二甲基化/对称二甲基化、三甲基化等多种形式。精氨酸甲基化参与转录调控,介导DNA损伤修复。赖氨酸甲基化可调控组蛋白功能,参与基因转录的表观调控。 利用针对不同甲基化位点和修饰形式的基序抗体对甲基化肽段富集后,再用LC-MS/MS分析,实现大规模甲基化蛋白质定性定量分析。

实验流程



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应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定列表层次聚类热图(cluster)COG/KOG分析
肽段鉴定定量列表修饰位点统计绘图GO富集分析
修饰位点鉴定定量列表GO功能富集图KEGG富集分析
肽段保守motif分析列表KEGG通路图蛋白质互作网络分析
GO功能列表保守motif分析互作网络Module分析
KEGG信号通路Mapping表//

技术优势

▶ 采用CST优质抗体,特异性高;

▶ 鉴定通量高,一次最高检测超过25000个磷酸化修饰位点;

▶ 上万篇文献见证。

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