五重爆款组学礼包第五弹：基因表达与功能调控专场

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礼包特色

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参考经典案例

案例1：肿瘤分型研究-转录组学+DIA

题目：Breast cancer classification based on proteotypes obtained by SWATH mass spectrometry

研究对象：乳腺癌组织

发表期刊：Cell Reports

影响因子：7.8

研究单位：马萨里克大学与瑞士苏黎世大学Ruedi Aebersold教授课题组

实验结论：通过SWATH（DIA）+转录组学技术研究，发现乳腺癌组织蛋白质亚型与常规分类亚型之间的一致性高达84%。并进一步揭示3种对分类贡献最大的关键蛋白质。

案例2：饮食限制与健康寿命研究-转录组学+非靶代谢组学

题目：Untangling determinants of enhanced health and lifespan through a multi-omics approach in mice

研究对象：小鼠肝脏组织

发表期刊：Cell Metabolism

影响因子：22

研究单位：美国国立卫生研究院、美国威斯康星大学麦迪逊分校

研究结论：通过代谢组和转录组联合分析，揭示寿命与健康调控关键是基因与代谢重塑，不同饮食模式与肝脏排毒的保护机制的适应和参与相关，并发现了潜在长寿相关途径Gly-Ser-Thr代谢.

案例3：油菜油量积累-转录组学+脂质组学

题目：Cellular plasticity in response to suppression of storage proteins in the brassica napus embryo

研究对象：油菜种胚

发表期刊：Plant Cell

影响因子：8.6

研究单位：德国莱布尼茨大学植物基因与作物研究所

实验结论：通过转录组测序、蛋白质组、脂质组、靶向代谢等多种组学技术，揭示过量的油质蛋白和卵磷脂诱导形成大的、含油质蛋白的质膜叠堆。这些堆叠的质膜取代了正常的液泡，并且不能贮藏脂质。

解读链接：Plant Cell：重大进展！高油油菜育种瓶颈有望突破！

案例4：玉米淀粉代谢中调控机制-转录+代谢

题目：Maize sugary enhancer1 (se1) is a gene affecting endosperm starch metabolism

研究对象：玉米胚乳

发表期刊：PNAS

影响因子：9.58

研究单位：美国威斯康星大学麦迪逊分校

实验结论：利用转录组学和代谢组学分析及后期验证分析，揭示了影响玉米甜味的关键机制——Se1基因损伤影响淀粉代谢，导致蔗糖和麦芽糖积累，从而影响玉米甜味。

解读链接：玉米甜味大揭秘！PNAS：胚乳基因突变影响淀粉代谢

中科新生命项目文献（部分）

[1] A complete route for biodegradation of potentially carcinogenic cyanotoxin microcystin-LR in a novel indigenous bacterium. Water Research. 2020; 17.【转录+蛋白，IF 7.9】

[2] Oral secretions from Mythimna separata insects specifically induce defence responses in maize as revealed by high-dimensional biological data. Plant Cell Environ. 2016; 1749-1766. 【转录组、代谢组、蛋白质组，IF 6.1】

[3] Cold-induced lipid dynamics and transcriptional programs in white adipose tissue. BMC Biol. 2019；17(1): 74. 【脂质组+转录组，IF 6.7】

[4] Integrated analysis of transcriptomic, miRNA and proteomic changes of a novel hybrid yellow catfish uncovers key roles for miRNAs in heterosis. Mol Cell Proteomics. 2019; 18(7): 1437-1453. 【转录组+miRNA+TMT+PRM，IF5.2】