中科项目文章精选 | 翻译后修饰组研究应用大盘点

生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质相对丰度控制，还会被各种时空特异分布、可逆的翻译后修饰调控，因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样生物功能的一个重要前提。

近些年，修饰蛋白质组学相关的文献数量及质量显著提升。中科新生命客户也发表了修饰组学相关的高水平文章，研究领域包括药物筛选及作用机制、代谢心血管疾病、植物发育胁迫等。本期，小编精选近一年客户项目文章案例推荐给各位老师。

利用基于质谱的DIA蛋白质组学、磷酸化label-free蛋白质组等多种技术，研究了低剂量索拉非尼作为线粒体解偶联剂改善非酒精性脂肪性肝炎机制。研究发现，索拉非尼的低剂量治疗明显改善了非酒精性脂肪肝的主要特征，包括肝脂肪变性、炎症和纤维化，而没有引起任何可检测到的不良事件。

本研究工作发现了治疗动脉粥样硬化的新靶标—P2RY12受体，并结合分子生物学、磷酸化label-free蛋白质组学等方法，解析了新靶标介导晚期动脉粥样硬化进程的分子机制：P2RY12受体活化后通过PI3K/AKT信号途径促进自噬关键分子mTOR磷酸化，抑制VSMCs来源的泡沫细胞自噬，阻止细胞内脂滴降解促进其泡沫化，最终导致斑块脂质核心变大和斑块进展。

本研究工作从人科动物特异性基因USP6出发，探究了USP6在脑组织中发挥学习、记忆调控功能的重要性，随后通过泛素化label-free蛋白质组等方法，证明USP6是一个新的NMDA受体的去泛素化酶，其作为一个新的NMDA受体调控因子，可通过去泛素化途径调节NMDA型谷氨酸受体的降解和稳定性，进而调控突触可塑性和学习记忆能力，并可能在人类智力进化过程中发挥着关键作用。

为了研究线粒体代谢功能关键调节因子Sirt3对败血症诱发的心肌功能障碍（SIMD）的作用与机制。通过乙酰化label-free蛋白质组、能量代谢组分析，发现Sirt3的缺失导致心脏三羧酸（TCA）循环内关键酶的过度乙酰化，以及乳酸和NADH的产生，继而导致败血症后心脏功能障碍。并基于研究机制，评估了大黄素作为Sirt3调节剂用作治疗SIMD的潜在治疗价值，或为脓毒症后维持正常的心脏表现提供一种潜在的治疗新方法。

CBL家族是植物特有的一类钙感受器，能够与蛋白激酶CIPK家族互作，进化出众多家族成员并组成复杂的互作网络，广泛参与植物对环境的响应。本研究通过突变技术、pull down互作、磷酸化iTRAQ蛋白质组学技术等，系统研究并鉴定到了一条新的CBL-CIPK通路，结合功能验证，发现其通过与液泡膜定位的糖转运子TST互作进而调控葡萄糖向液泡的转运，从而将钙信号转导和糖稳态调节紧密结合起来，为提高作物的品质和逆境抗性提供了重要的理论指导。

通过定量N-糖基化修饰蛋白质组学等技术，系统鉴定了稻瘟病菌N-糖基化修饰靶标蛋白，发现N-糖基化修饰可通过靶标蛋白协调稻瘟菌不同发育和致病过程，结合功能验证分析，揭示了N-糖基化修饰通过调控内质网质量控制系统（ERQC）参与致病过程的分子机制，为开发真菌病害防控策略提供新的思路，以及研发新的杀菌剂提供新的候选靶标。