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中科新生命首批购入timsTOF Pro 2,推动蛋白质组学创新高

2021-10-29

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为了更好地满足客户的需求,提高检测准确度和精准度,近日中科新生命在已有timsTOF Pro质谱的基础上,率先引进timsTOF Pro 2,成为国内首家购入该仪器的科研服务企业。


相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了最新一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精准,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。

特色一、助力4D-DIA临床大队列蛋白质组,挖掘复杂样本更多信息

大队列临床样本如最常见临床血液样本,往往存在高低丰度蛋白。4D-DIA蛋白质组在基于数据非依赖采集(DIA)的全息扫描模式分析同时,搭载基于双TIMS技术的 PASEF(平行累积连续碎裂)技术,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,由 PASEF驱动的 timsTOF Pro 2可以实现超过100 Hz的扫描速度,而不会损失灵敏度和分辨率,进一步实现对低丰度肽段离子多次重复选择并碎裂,以提高低丰度肽的二级谱图质量,从而实现了更高置信度的肽谱匹配(PSM)。在保证高通量分析基础上,为临床大队列样本的高低丰度蛋白检测灵敏度和可信度带来更进一步提升。

特色二、助力4D-修饰蛋白质组学,实现更微量更深度检测性能升级

dia-PASEF在timsTOF Pro 2的性能改进(高灵敏度、扫描速度、重现性)为4D-修饰蛋白质组学更微量更深度带来无限可能。磷酸化、泛素化、乙酰化等翻译后修饰,广泛参与至肿瘤、药物、代谢、免疫等过程中,但极低修饰肽段丰度对起始样本量提出更高要求。在最新升级的timsTOF Pro 2官方测试中,通过检测小鼠脑样本的磷酸化蛋白质组,在起始总蛋白量仅为25 μg的磷酸化蛋白质组的非标记定量分析中,三次重复鉴定出多达 4473 个磷酸化肽段;在150ug的蛋白质中鉴定27768条特异性磷酸化肽段,同时基于TIMS和PASEF组合,成功分离了457种共洗脱的磷酸化异构体,精确区分了相近修饰位点定位的同分异构修饰肽段。这些结果为更微量样本的修饰分析带来可能,为进一步扩充疾病信号通路、修饰信息提供补充。

中科新生命引进最新的仪器设备timsTOF Pro2,将为我们的合作伙伴提供更加精准的数据结果和更加优质的服务,助推多组学研究迈向新高度。


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