深度空间代谢组学Q&A（二）| 数据处理常见问题

各位看官大家好！空间代谢组Q&A又和大家见面啦！上一期，我们介绍了空间代谢组学的工作流程及样本准备小技巧（点击阅读）。这一期，我们将为大家继续解答数据处理中的常见小问题

Q1 深度空间代谢组学如何进行数据处理方式是什么？
深度空间代谢组学的原始数据通过SCILS^TM Lab软件处理。SCILS^TM Lab是由Bruker公司针对空间代谢组学数据特点而开发的商业化质谱成像分析软件。该软件很好地解决了传统数据处理中，涉及空间和高维代谢组信息整合时，难以准确展现真实分子层面的变化的痛点。目前该软件被广泛使用，堪称分析利器。

Q2 SCILS^TM Lab的优势是什么？
1.  内部逻辑稳定，集成完整质谱数据标准化与成像分析功能，输出数据可追溯；
2.  集成下一代机器学习集成算法，支持临床大队列分析比较，多样本/多区域/3D成像整合处理；
3.  高效的谱图解析功能，可实现深度挖掘关键代谢物信息；
4.  可视化操作，数据随时可调，快速交付。

Q3 深度空间代谢组分析是如何进行代谢物定性的？
传统空间代谢组学定性指标有两种，分别是MS1(一级质谱)和MS2（二级质谱）。在新一代空间代谢组学技术中，利用离子淌度捕集装置，针对离子横截面积不同的特点进行分离，形成第三个定性指标CCS值。深度空间代谢组学基于tims-TOF flex MALDI 2开发，可以根据实验需求，结合中科本地标准品数据库以及Bruker商业代谢物数据，实现上述三种指标的定性分析，大幅提升代谢物鉴定准确性。

Q4 深度空间代谢组学数据分析结果示例

关于每种分析具体功能和应用方向，我们会在下一期空间代谢组学Q&A中详细介绍讨论，敬请各位期待~

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深度空间代谢组学：
· MALDI 2离子化策略—检测更灵敏、覆盖更全面；
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