项目文章JCI（IF 19.5） 暨南大学张冬梅教授团队利用转录+蛋白联合解析结直肠癌肝转移药物耐药新机制

结直肠癌 (Colorectal cancer, CRC) 在恶性肿瘤中发病率排第三，死亡率占据第二位，并且CRC肝转移（CRCLM）的死亡率超过70%。目前常用于治疗CRCLM的药物是血管生成抑制剂贝伐单抗，然而，经常出现先天性或获得性耐药导致治疗失败和癌症复发。已有研究证明CRCLM能够通过血管劫持（vessel co-option）过程产生耐药，血管劫持过程指的是随着时间的推移，肿瘤可学会“劫持”周围组织的正常血管对药物产生耐药性，不过针对血管劫持机制的研究主要集中“劫持者”肿瘤细胞方向，而“被劫持者”窦状毛细血管方向的作用机制还尚未探索。组学技术的快速发展和应用为复杂疾病的机制探究提供了便利，技术的革新更是将人类健康和疾病的研究推上了新的台阶。

2022年8月，来自暨南大学的张冬梅教授团队在Journal of Clinical Investigation （IF 19）在线发表题为“Targeting FAPα-expressing hepatic stellate cells overcomes resistance to anti-angiogenics in colorectal cancer liver metastasis models”的研究成果，该研究整合转录组学和蛋白质组学技术深度解析了靶向表达FAPα的肝星状细胞可以克服结直肠癌肝转移模型中抗血管生成药物的耐药性的分子机制。该研究发现贝伐单抗耐药的肿瘤细胞成纤维细胞生长因子结合蛋白 1 (FGFBP1)上调表达，FGFBP1通过增强HSCs旁分泌FGF2-FGFR1-ERK1/2EGR1信号通路诱导FAPα表达，FAPα促进肝星状细胞（HSC）中CXCL5的分泌，从而激活CXCR2以促进肿瘤细胞的上皮-间质转化和募集骨髓来源的抑制细胞产生耐，通过靶向FAPα⁺ HSC能够有效的破坏窦状毛细血管的选定和克服贝伐单抗耐药性。中科新生命为其提供了转录组学和TMT蛋白质组学技术服务。

人结直肠癌肝转移组织标本；结肠直肠癌细胞系；小鼠

研究者通过异种移植贝伐单抗敏感的HCT116细胞到小鼠肝脏，然后使用10mg/kg的贝伐单抗处理42天产生耐药模型，使用贝伐单抗耐药的细胞HT-29作为对照组（Fig1 A）。结果发现，在贝伐单抗耐药组的病理学生长模式以RHGP为主要模式(Fig1 B)，并且免疫荧光结果显示贝伐单抗获得性耐药的HCT116 CRCLM异种移植模型中发生血管选定（CD31⁺）的数量更多(Fig1 C)。通过进一步针对贝伐单抗耐药组中出现血管选定的血管特征进行分析发现，FAPα蛋白主要在αSMA⁺ HSCs表达，而在对照组中无表达(Fig1 D)。这些结果提示结直肠癌肝转移中血管选定导致贝伐单抗耐药可能与HSCs中FAPα的表达有关。

研究者接下来探索了FAPα在HSCs中对血管选定的作用。结果显示，FAPα条件性敲除后血管选定的数量减少(Fig2 C)，GR-1⁺髓源性抑制性细胞的募集明显受到抑制(Fig2 D)，CD8⁺T细胞的数量明显升高(Fig2 E)，FAPα条件性敲除后RT-PCR结果显示间充质细胞标志蛋白vimentin和N-cadherin的表达水平显著下调，上皮细胞标志蛋白E-cadherin显著上调，因此推测FAPα⁺HSCs可能是通过预先建立免疫抑制生态位，诱导肿瘤细胞EMT促进血管选定。

为探讨HSCs表达FAPα促进血管选定的分子机制，研究者运用蛋白质组学方法对贝伐株单抗敏感和耐药的HCT116 CRCLM异种移植肿瘤进行了分析，结果显示在贝伐单抗耐药的肿瘤中检测到17个上调表达的蛋白(Fig4 A)，并且通过RT-PCR确认FGFBP1基因表达水平也最为显著(SFig4 A&B)。免疫组化染色、Western blotting和ELISA检测显示，在贝伐单抗耐药的CRCLM异种移植体系（HCT116和HT-29）的肿瘤组织和原代细胞中FGFBP1均高表达(Fig4 B-D)。为探讨FGFBP1对HSCs中FAPα表达和血管选定的作用机制，在HCT116细胞上构建了FGFBP1基因过表达细胞系，在HT-29细胞上构建了FGFBP1基因干扰表达细胞系，HE染色结果显示过表达FGFBP1后RHGP的比率显著升高，相反，干扰FGFBP1的表达之后RHGP的比率显著降低(Fig4 E)。同时，在免疫荧光结果中过表达FGFBP1后血管选定的数量和阳性表达FAPα蛋白的HSCs数量也显著增多，干扰之后数量就会减少(Fig4 F，G)。

接下来，研究者针对FGFBP1诱导HSCs表达FAPα蛋白的机制展开探索，由于FGFBP1能够通过细胞外基质（ECM）释放FGF2来增强FGFR1信号通路，所以研究者检测了LX-2细胞系中FGF2和FGFR1的基因表达水平，发现其确实高于其他的FGFs和FGFRs（sFig6 A，B）。另外，FGF2和磷酸化的FGFR1在阳性表达FAPα蛋白的HSCs中表达水平升高（sFig6 C），说明FGFBP1可能是通过FGF2-FGFR1信号通路来诱导HSCs表达FAPα蛋白的。鉴于ERK1/2-EGR1轴位于FGFR1的下游，而EGR1能够与FAP基因的启动子结合诱导FAPα的表达，所以研究者认为FGFR1激活诱导HSCs中FAPα的表达可能受ERK1/2-ERG1轴的调控。因此研究者就通过WB检测了FGFR1和ERK1/2的磷酸化状态以及EGR1和FAPα的表达水平，发现FGFBP1过表达之后这些标志蛋白的表达水平均显著上调（Fig5 A）。此外，敲除RGR1基因后FAPα的表达水平显著下调（Fig5 D），进一步对研究的猜想进行了验证。