修饰蛋白定量分析 • O-GlcNAc糖基化蛋白质组
· 产品定义
O-GlcNAc糖基化是指将单个N乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）分子连接在蛋白质丝氨酸或苏氨酸的羟基氧原子上的一种翻译后修饰，是O-糖基化修饰中一种常见且特别的单糖修饰。该修饰是一个动态可逆的过程，由乙酰氨基葡萄糖转移酶(OGT)负责糖基化、N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(OGA)负责去糖基化。GlcNAc的合成是通过己糖胺生物合成途径（HBP），当外界营养条件或应激环境变化时，会导致许多功能蛋白上O-GlcNAc发生变化，故O-GlcNAc被认为是一种营养和应激感受器。 O-GlcNAc参与了代谢相关的多种重大疾病，如肿瘤代谢、心血管代谢、肝脏胰岛素代谢、昼夜节律、感染免疫等。另外，由于O-GlcNAc 修饰与磷酸化修饰均发生在蛋白质的Ser/Thr残基上，两种修饰间存在着“阴阳”调控关系。发生O-GlcNAc糖基化修饰的丝氨酸/苏氨酸上共价连接单个N-乙酰葡糖胺（GlcNAc）单糖，其分子量会相应的增加203.08Da。质谱能够精确地测定分子量是否发生相应的质量偏移，实现O-GlcNAc糖基化修饰肽段及位点的分析。
4D Label free O-GlcNAc糖基化蛋白质组是基于布鲁克timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行O-GlcNAc糖基化蛋白质组学分析。4D Label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
· 技术路线
· 技术优势
1. 关注度持续攀升的O糖修饰，研究潜力巨大
2. 4D质谱仪加持，更高鉴定深度、更准确位点定位
3. 进口金标抗体，保证实验过程稳定性
4. O-GlcNAc+磷酸化联合，解析Ser/Thr位点上的修饰crosstalk或竞争性修饰
· 数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图 |
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表达差异分析 |
差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图； |
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功能分析 |
亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析 |
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质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
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高级数据分析 |
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功能分析 |
GSEA富集分析 |
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临床药物研究 |
药物靶点注释 |
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标志物筛选 |
集成机器学习 |
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与临床表征的联合分析 |
ROC分析；WGCNA分析 |
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关于个性化数据分析需求，请来电咨询 |
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· 推荐组合产品
O-GlcNAc+磷酸化联合分析
· 推荐应用领域
1. 代谢疾病（肿瘤、心血管、糖尿病）
2. 感染与免疫
· 送样建议
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样品类型 |
推荐送样量 |
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动物组织类 |
常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等） |
≥ 200mg |
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植物组织类 |
柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等） |
≥ 500mg |
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细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥ 1×10^8 |
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微生物类 |
菌类 |
≥ 200mg |
· 应用案例
1. High dietary fructose promotes hepatocellular carcinoma progression by enhancing O-GlcNAcylation via microbiota-derived acetate. 2023. Cell Metabolism（IF 29）
代谢组联合O-GlcNAc糖基化修饰组揭示高果糖饮食促进肝癌进展的新机制
2. O-GlcNAcylation of YTHDF2 promotes HBV-related hepatocellular carcinoma progression in an N6-methyladenosine-dependent manner. 2023. Signal Transduction and Targeted Therapy (IF 39.3 )
YTHDF2的O-GlcNAc糖基化以N6依赖的方式促进HBV相关肝细胞癌进展
3. The Protein Modifications of O-GlcNAcylation and Phosphorylation Mediate Vernalization Response for- Flowering in Winter Wheat. 2019. Plant physiology. (IF: 8.34)
O-GlcNAc+磷酸化动态调控春化作用介导小麦开花