技术服务

技术服务

Multi-omics Services

多组学服务

代谢组—土壤代谢组

您现在的位置:首页 - 多组学服务 - 土壤代谢组 - 土壤代谢组

土壤代谢组

合作交流

土壤中的代谢物主要来自于植物根际分泌物及微生物对有机质的降解。土壤微生物的代谢活动对生物残体的分解、土壤结构形成、有机物转化、有毒物质的降解等过程有至关重要的作用。另一方面也有研究表明,植物根际分泌物可以调节与根际微生物的互作关系。对土壤中的代谢物进行检测分析,对于土壤菌落功能、环境毒理、植物环境互作、土壤质量评价等方向研究具有重要意义。

产品定义:利用基于LC-MS的非靶向代谢组学方法对土壤中的代谢物进行定性和相对定量分析。


实验流程

image.png

数据分析

分析类型

分析内容

质控

TIC、QC等多项

轮廓分析

Superclass分类

差异分析

单变量统计分析(火山图等)

多维统计分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等

功能分析

层次聚类分析

相关性分析

KEGG分析

高级生信分析

WGCNA分析

回归分析

趋势聚类分析

机器学习

image.png


参考文献

1.

Song Y ,  Li X ,  Yao S , et al. Correlations between soil metabolomics and bacterial community structures in the pepper rhizosphere under plastic greenhouse cultivation[J]. Science of The Total Environment, 2020, 728:138439.

2.

Li X ,  Song Y ,  Bian Y , et al. Insights into the mechanisms underlying efficient Rhizodegradation of PAHs in biochar-amended soil: From microbial communities to soil metabolomics[J]. Environment International, 2020, 144:105995.

3.

Li X ,  Qu C ,  Bian Y , et al. New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme activity and sequencing analysis with metabolomics[J]. Environmental Pollution, 2019, 255:113312.

推荐技术

合作交流

请填写您的需求表格,我们会安排专业的工作人员与您联系!

*

*

*

*

*