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高通量测序—转录组测序

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单细胞转录组

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单细胞转录组测序,以单个细胞为特定研究对象进行转录组测序,并对获得的数据进行生物信息学统计分析的新技术。基于微流控和 barcode 标记等技术可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。

实验流程

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应用方向


²  组织/器官细胞图谱的构建;


²  肿瘤细胞的异质性及微环境研究;


²  免疫组学研究;


²  神经分化发育研究。


数据分析

标准信息分析

高级信息分析

测序数据质控和定量

细胞亚群注释

细胞亚群分类

RNA速率

Marker基因分析

细胞通讯

差异基因富集分析

CNV分析(肿瘤样本)


技术优势


²  超高的细胞通量,每个样本检测的细胞数可达1K-10K


²  方便快捷,10分钟内可完成上万细胞的捕获;


²  灵敏度高,单细胞捕获效率高达65%


²  可适性高,适合大部分细胞类型。


参考文献

1.

Nowotschin S , Setty M , Kuo Y Y , et al. The emergent landscape of the mouse gut endoderm at single-cell resolution[J]. Nature, 2019.

2.

Maynard A , Mccoach C E , Rotow J K , et al. Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing[J]. 2020.

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