微生物测序 • 宏基因组测序

· 产品定义

宏基因组学(metagenomics)以环境样品中的微生物群体所有基因组作为研究对象，利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。与扩增子测序相比，宏基因组测序不仅对于物种鉴定精度更高，更能同时注释KEGG、CAZy、COG、CARD等功能数据库，获得数倍于扩增子测序的微生物组组成及功能信息。

· 技术路线

· 技术优势

1. 样本处理经验丰富：粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本

2. 平台优：基于优质的Illumina测序平台，数据质量高

3. 分析内容丰富：可选择与各种代谢组学产品进行组学联合分析

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐组合产品

1. 宏基因组+代谢组：环境/宿主表型变化的微生物互作研究

2. 宏基因组+16S：环境/宿主微生物群落结构和功能潜能研究

3. 宏基因组+代谢组+转录组：宿主和微生物的协调响应机制研究

· 推荐应用领域

1. 代谢病研究：肥胖、糖尿病等代谢疾病与肠道菌群的关联

2. 肿瘤研究：肠道微生物调控肿瘤免疫作用机制

3. 营养科学：功能性食品及畜禽饲料的功效机制研究

4. 生物能源：生物质降解微生态研究

5. 环境科学：污染物降解、耐性基因抗性分布等研究

· 送样建议

· 应用案例

文章题目：Environment alcadmium exposure facilitates mammary tumorigenesis via reprogramming gut microbiota-mediated glutamine metabolism in MMTVErbb2 mice

发表期刊：Science of the Total Environment (IF=10.753)

宏基因组-小鼠粪便-结合代谢组学证实，Cd暴露诱导肠道菌群失调、肠道通透性升高和肿瘤内谷氨酰胺代谢增加，从而促进乳腺肿瘤的发生