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代谢组—深度空间代谢组

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深度空间代谢组学

合作交流

实验流程



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应用方向



细胞层面的组织结构异常复杂,由不同的细胞表型组成,每一种细胞在生理/疾病过程中都在执行着不同的生化过程。这种变化只有通过对组织进行原位分析,


才能最直接和准确的发现细胞内的分子变化,进而更好的理解背后所对应的生理/疾病机理,深度空间代谢组学正是针对不同细胞表型分子层面变化的分析利器。

 

1.临床医学——图像数字化,病理/分型辅助诊断更全面


通过深度空间代谢组学对肺肿瘤组织进行分析,获取关键代谢物在肿瘤进展中的空间变化特征,从而进行辅助诊断。


2.生命科学——代谢网络直观呈现,生长发育/标志物研究更深入


小鼠脑组织中不同区域脂质随着生理过程发生变化。


3.靶向空间代谢组


靶向检测药物/目标代谢物在各组织中的分布,利用图像及质谱数共同判断药物是否精准释放及释放效果是否符合预期,或者验证目标代谢物在生理病理过程中


是否伴随空间变化。


数据分析

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更多个性化空间分析等您探索:


1.      聚类区域差异特征分析


2.      目标区域差异特征分析


3.      代谢物生物信息学分析



技术优势

多维度分离:传统空间代谢组学分子激发后直接进入质谱检测,分离维度单一。中科新生命基于对离子淌度捕集(Trapped Ion Mobility SpectrometryTIMS)技术的熟练运用,现将TIMS应用于深度空间代谢组学,增加“淌度谱”分离维度,搭配代谢物淌度数据库,全面提升检测准确度和深度。

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图 淌度分离——进入质谱前离子在气流和电场力的带动下逐步分离

更灵敏、高效的代谢物离子化策略:深度空间代谢组借助革新性MALDI 2离子源系统的独特后电离技术,对代谢物分子连续进行两次电离,全面提升检测深度,总检测feature数突破2000

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图 脑组织实测项目结果展示

相比传统MALDI成像系统,MALDI-2显著提升整体代谢物信号强度1-3个数量级,原本难以检测的代谢物分子和低丰度代谢物清晰成像。

 

集成化数据处理工作站:引入全球领先的质谱成像数据分析软件SCiLS™ Lab,数据可视化,一键处理,工作逻辑稳定可靠,集成功能丰富,分析结果无缝接入,简单可调,给您带来优质快速的数据处理体验。

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SCiLS™ Lab分析界面——一键式成像分析


送样建议

样本分类

样本类型

样本大小

样本要求

动物组织

肿瘤组织;脑组织;肾脏组织等

建议1 cm2以内

超出请提前与我们联系

l     新鲜成型的组织样本;

l     送样前应除去血液、体液残留、保持样本干燥;

l     未进行HE染色、荧光标记,保护液浸泡。

植物组织

根、茎、叶、种子等

植物样本请提前与我们联系

l     新鲜成型的组织样本;

l     送样前应除去多余的水分,保持样品干燥;

l     含水量不可超过80%

切片


建议1 cm2以内

超出请提前与我们联系

l     需使用bruker MALDI 2专用导电载玻片,开展项目前请与我们联系获取

l     建议总大小不超过15mm*65mm,一块载玻片上可以放置多个切片。

l     切片样本如需HE染色,请同时寄送对应备份样本

其它样本



请提前联系评估

样本类型

推荐重复数

临床样本/大型动物

5个以上生物学重复

动物模型(大/鼠)

3个以上生物学重复

植物

5个以上生物学重复


合作交流

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