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代谢组—靶向代谢组学

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糖类 (Targeted Metabolomics)

合作交流

糖类是自然界中广泛分布的一类重要的有机化合物,是一切生命体维持生命活动所需能量的主要来源,在生命活动过程中起着重要的作用。植物中最重要的多糖是淀粉和纤维素,动物细胞中最重要的多糖是糖原。最终多糖会被分解,并以单糖的形式被生物体代谢供能或者转化为其它成分。本方法利用基于LC-MS的靶向代谢组方法对糖类的8种单糖物质进行绝对定量分析。

检测指标

编号

代谢物名称

Metabolites

1

D-Mannose

甘露糖

2

D-Ribose

核糖

3

L-rhamnose monohydrate

鼠李糖

4

D-Galactose

半乳糖

5

Glucose

葡萄糖

6

L-Arabinose

阿拉伯糖

7

D-Xylose

木糖

8

L-Fucose

岩藻糖


实验流程


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应用方向

生物领域多个研究方向,如

植物抗逆、生长发育、育种、果实营养品质等相关研究;

糖代谢途径研究;

糖生物活性研究;

生物标志物、药物治疗研究等。


数据分析

分析类型

分析内容

拟解决问题

质控

QC RSD

获得高质量数据

差异分析

单变量统计分析t.   test

反应每个代谢物的组间差异

箱线图

反应单个代谢物在组见的变化

功能分析

层次聚类分析

获得代谢物的表达模式信息

KEGG分析

获得相关代谢通路和生物学功能

高级生信分析

回归分析

建立重要代谢物和其他指标的关联

趋势聚类分析

探讨代谢物的含量趋势模式

机器学习ROC

筛选诊断性能良好的生物标志物


技术优势

(1) 高灵敏度:基于LC-MS平台检测方法保证检测灵敏度,精确定性、绝对定量;

(2) 适用性广:支持细胞、组织、体液多种样本类型;

(3) 严格质控:多重质控,标准品人工校对。

(4) 快速交付:16个工作日


送样建议

样本类型

常规送样量

最低送样量

建议生物学重复

血(血清、血浆)

200 μL

100 μL

临床样本:每组≥ 30

动物来源:每组≥ 10

植物来源:每组≥ 3

细胞样本:每组≥ 6

尿液

200 μL

100 μL

动物组织

100 mg

60 mg

细胞

10^7

10^7

细胞上清

1mL

500 μL

细菌或真菌

沉淀湿重≥200 mg

沉淀湿重≥100 mg

发酵液

500 μL

200 μL

卵泡液、脑脊液、淋巴液等

200 μL

100 μL

植物组织

400 mg

200 mg

植物种子

400 mg

200 mg

其他特殊样本

请联系我们咨询


参考文献

1.

Mardinoglu A , Alena Stanáková,  Lotta L A , et al. Plasma Mannose Levels Are Associated with Incident Type 2 Diabetes and Cardiovascular Disease [J]. Cell Metabolism, 2017.

2.

Sullivan W J ,  Mullen P J ,  Schmid E W , et al. Extracellular Matrix Remodeling Regulates Glucose Metabolism through TXNIP Destabilization[J]. Cell, 2018:S009286741831033X-.

3.

Zeng T, Fang B, Huang F, Dai L, Tang Z, Tian J, Cao G, Meng X, Liu Y, Lei B, Lu M, Cai Z. Mass spectrometry-based metabolomics investigation on two different indica rice grains (Oryza sativa L.) under cadmium stress. Food Chem. 2021 May 1;343:128472.

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