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翻译后修饰组—修饰蛋白定量分析

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完整N-糖肽

合作交流

完整N-糖肽蛋白质组通过ZIC-HILIC 富集方法,并结合最新一代超高分辨质谱,可实现N-糖基化位点和糖型组成的完整解析和糖基化的大规模定性定量分析。


实验流程

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应用方向

生物标志物筛选

分子分型

修饰表达谱


数据分析

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技术优势

位点和糖型组成一步分析到位

富集方法无偏向、高特异性、高通量

分析软件pGlyco 3.0,糖链、多肽和糖肽三维度质控


送样建议

样本类型

推荐送样量

预处理及注意事项

蛋白量需求:≥1mg

动物组织

动物心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺等

50mg/

取材新鲜组织,用PBS 清洗组织表面,去除血渍及非目标组织

植物组织

植物根、茎、叶、果实等

1g/

(根和果实适当多送一些)

取材新鲜组织,尽可能的去掉状态不好的部分及杂质,保持样品的一致性。样本离体后迅速液氮速冻5min以上然后-80℃保存

细胞

细胞沉淀

1-2*107个细胞/样 或者

10μl细胞沉淀/

去掉培养基并用PBS溶液清洗后收集细胞,细胞沉淀再用PBS清洗三遍

血液

血清/血浆

200μl/

根据实验需求选择合适的采血管收集血液样本,3000rpm离心10min,收集血清/血浆,建议加入蛋白酶抑制剂混匀 后-80℃保存样本(更好的保证样本的稳定性)

唾液

2ml/

禁食两小时以上,9-12am取样,1000g-2000g离心或使用0.22um滤膜过滤收集唾液,-80℃保存

泪液

1ml/

收集样品(可利用capillary   micropipetteSchirmer strip),   4℃8000-14000g 离心取上清,-80℃保存。


物种限制:人、大鼠、小鼠、拟南芥


参考文献

1、Proteogenomic characterization of pancreatic ductal adenocarcinoma.Cell. (IF 66.850)                 

胰腺癌潜在治疗靶点与早期诊断标志物

2、Glycoproteomics-based signatures for tumor subtyping and clinical outcome prediction of high-grade serous ovarian cancer. Nat Commun.(IF 17.694)

完整N-糖肽在分子分型研究中的应用

3、Precision N-Glycoproteomic Profiling of Murine Peritoneal Macrophages After Different Stimulations. Front Immunol.(IF 8.786)

完整N-糖肽修饰表达谱

 


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