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10Xgenomics单细胞转录组测序

合作交流



10Xgenomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互作用等分析内容,从而获得高分辨率的细胞图谱。

实验流程

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应用方向

·   细胞图谱的构建;

·   细胞异质性及组织微环境研究;

·   免疫调控研究;

·   神经分化发育研究;

·   疾病机制研究;

·   药物动力学研究。


数据分析

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部分数据分析结果展示

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技术优势

·   完备的细胞捕获平台(Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器);

·   丰富的样本处理经验(如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本);

·   高标准实验环境,进口试剂耗材,最大限度消除各种不良因素影响,保障建库质量;

·   强大的生信团队,可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。


送样建议

(1)    样品总量:制备成细胞悬浮液,一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个;

(2)    样品浓度:最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL;

(3)    细胞活性:活细胞数目在85 %以上;

(4)    细胞大小:直径小于40 μm;

(5)    细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质;

(6)    血液样本需要用EDTA抗凝管收集,不能采用含有肝素的抗凝管;

(7)    植物样本需制备成原生质体。


参考文献

1.Shengqian Dou,et al,Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege.Ocular Surface.2021.DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010.

2.Li SB,et al.Hyperexcitable arousal circuits drive sleep instability during aging.Science.2022.doi: 10.1126/science.abh3021.

3.Andrew C. Yang,et al.A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer’s risk.Nature.2022.DOI: 10.1038/s41586-021-04369-3.


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