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高通量测序—微生物测序

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16S/ITS/18S扩增子测序

合作交流

扩增子测序是指对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,突破传统微生物不可培养的缺点,获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

实验流程


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应用方向

1. 生理/病理机制:肠道/口腔/皮肤/生殖等微生物群落的影响机制

2. 植物共生胁迫:土壤根际微生物与植物的互作机制

3. 精准医学:肠道微生物及多组学疾病标志物

4. 药物研发:基于肠道微生物作用机制的药物研发

5. 环境能源:环境、土壤、水体微生物群落研究


数据分析

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部分数据分析结果展示


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技术优势

1. 样本处理经验丰富:粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本

2. 测序灵活:多种测序策略,可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求

3. 平台优、数据质量高:基于优质的Illumina NovaSeq测序平台,数据质量高

4. 分析内容丰富:可选择与各种代谢组学产品进行组学联合分析


送样建议

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参考文献

文献名称:Depression and anxiety in patients with active ulcerative colitis: crosstalk of gut microbiota, metabolomics and proteomics

发表期刊:《Gut Microbes》(IF=10.245)

合作单位:江苏省中医院


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