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蛋白质组学—靶向蛋白质组

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标准PRM和PRM-plus

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PRM(平行反应监测,parallel reaction monitoring)是一种基于LC-MS/MS的靶向蛋白质分析技术,能够对目标蛋白、目标肽段(包括发生翻译后修饰的肽段)进行高选择性、特异性、重复性和准确性检测,从而实现对目标蛋白/肽段的相对或绝对定量分析。

实验流程



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PRM技术分析原理


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应用方向

▶ 蛋白质组结果验证

▶ 对目标蛋白质/肽段进行相对或者绝对定量检测

▶ 疾病标志物靶向检测

▶ 靶向药物的开发

▶ 生物通特定信号通路研究

数据分析

标准数据分析
图谱目标肽段离子图谱
定量差异分析目标肽段PRM定量原始结果
目标肽段和蛋白的定量结果
t test等单维统计学分析

技术优势

▶ 适用性广:无物种限制

▶ 通量高:可检测多达100个目标蛋白质,节省样本集实验成本

▶ 定量能力强:灵敏度可达ppm级别,线性范围可达5-6个数量级

▶ 特异性高:可精细区分亚型、修饰位点、突变位点等精细序列差异

参考文献

1.

Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.

TMT蛋白质组+PRM靶向验证-人脑组织+脑脊液-通过对大规模群体进行蛋白质组学检测,并采用WGCNA分析挖掘AD关键蛋白模块(包括能量代谢),揭示能量代谢紊乱对阿尔茨海默病早期功能障碍的重要影响

2.

Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.

蛋白质组学+PRM靶向蛋白组学-人血浆-通过“筛选-验证”的思路,挖掘了大量HBV-ACLF相关候选标志物,开发了慢加急性肝衰竭ACLF临床治疗中诊断及预后血浆蛋白标志物组合的研究

3.

Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.

PRM靶向蛋白组学-斑马鱼胰腺\肝脏-确定了RABL3突变作为癌症家族基因检测的靶点,并揭示了在发育和癌症中RAS活性失调的机制

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