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修饰蛋白质组学—修饰蛋白定性分析

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蛋白修饰位点分析

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基于LC-MS/MS分析能够准确测定蛋白质或多肽分子质量这一特性,从而检测蛋白质或者多肽上位点发生何种修饰。可检测修饰类型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、单甲基化、二甲基化、三甲基化。

实验流程



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应用方向

▶ 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;

▶ 糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;

▶ 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;

▶ 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;

▶ 甲基化:染色质结构及转录调控等;

▶ 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。

数据分析

数据分析
修饰蛋白质鉴定列表
修饰肽段和位点鉴定列表

技术优势

▶ 可一次性扫描三种常规修饰类型;

▶ 分析不局限于常规PTM,可根据确定的氨基酸位点和修饰类型进行个性化靶向修饰分析。

参考文献

1.

Acetylation of Lysine 201 Inhibits the DNA-Binding Ability of PhoP to Regulate Salmonella Virulence. PLoS Pathog. 2016.

乙酰化鉴定-沙门氏菌,揭示乙酰化修饰对细菌转录因子活性调控机制。

2.

Hepatitis B virus core protein sensitizes hepatocytes to tumor necrosis factor-induced apoptosis by suppression of the phosphorylation of mitogen-activated protein kinase kinase 7. J Virol. 2015.

co-IP磷酸化鉴定,研究细胞系-HBc蛋白引起肝损伤的致病机理。

3.

O-GlcNAcylation destabilizes the active tetrameric PKM2 to promote the Warburg effect. PNAS. 2017

丙酮酸激酶M2-PKM2 O糖鉴定-研究肿瘤瓦博格效应。


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