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翻译后修饰组—修饰蛋白定性分析

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蛋白修饰表达谱分析

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随着质谱技术的灵敏度和分辨率的提高,样本分离分级方法进一步优化,PTM的测序深度不断增加。单就磷酸化而言,深度测序技术在人类、拟南芥等生物中已可坚定到6万多个修饰位点。而在其他PTM上的表达谱研究也不断刷新着研究者们的已有认知。这无不向我们展示出PTM表达谱巨大的研究潜力。

实验流程



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应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;

▶ 糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;

▶ 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;

▶ 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;

▶ 甲基化:染色质结构及转录调控等;

▶ 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。

数据分析

蛋白质鉴定列表修饰位点统计绘图
修饰位点鉴定列表GO功能富集图
肽段保守motif分析列表KEGG通路图
GO功能列表保守motif分析
KEGG信号通路Mapping表蛋白质互作网络分析

技术优势

▶ 采用CST金标抗体富集,特异性高,结果可靠

▶ 鉴定通量高,可检测高达2.5+个磷酸化修饰位点


参考文献

1.

Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. 2020.Nature. (IF 49.962)

磷酸化修饰蛋白谱+蛋白组+转录组绘制拟南芥蛋白质组草图

2.

Proteome-wide identification and functional analysis of ubiquitinated proteins in peach leaves.2020.Scientific Reports. (IF  4.379) 【客户文献】

泛素化蛋白谱揭示泛素化在作物不同生理阶段中的作用

3.

N-glycosylation proteomic characterization and cross-species comparison of milk fat globule membrane proteins from mammals. 2016. Proteomics. (IF 3.984) 【客户文献】

构建哺乳动物乳汁脂肪球膜蛋白N-糖基化表达谱

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