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4D-乙酰化修饰及其他酰化修饰蛋白质组学

合作交流

蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,通过感应代谢环境变化而变化,同时其常在代谢酶上发生修饰,进而调控代谢通路及代谢酶的活性,参与下游游代谢物变化。蛋白质乙酰化(acetylation)是最常见的酰化修饰类型,是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团(如乙酰辅酶A等供体)共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位,其分子质量会相应增加42.01Da,质谱能够准确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。 4D-label free乙酰化修饰蛋白组学是基于timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行乙酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程


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产品类型

修饰位点

富集方法

推荐建议

          4D-label free乙酰化

Lys

             Acetyl-Lysine基序抗体

             1)微量样本分析

             2)高性价比分析

             3 )“有无差异”比较,样本间

                 表达模式差异较大的实验设计

          4D-label free琥珀酰化

Lys

             Succinyl-Lysine基序抗体

          4D-label free丙酰化

Lys

             Propionyl-Lysine基序抗体

          4D-label free丙二酰化

Lys

             Malonyl-Lysine基序抗体

          4D-label free戊二酰化

Lys

             Glutaryl-Lysine基序抗体


应用方向

能量代谢调控

代谢综合征研究

真菌细菌研究。


数据分析

标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图

蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析

质量控制分析

肽段相对分子质量分布、肽段序列长度分布




技术优势

▶ 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;

▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;

▶ 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;

▶ 经验丰富——超17年蛋白平台服务经验,拥有丰富的高水平项目文章;

▶ 数据保证——采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠;

▶ 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。


推荐组合产品: 打通表型-机制研究:乙酰化组+代谢组。


参考文献

1.

Sirt3 is a novel target to treat sepsis induced myocardial dysfunction by acetylated modulation of critical enzymes within cardiac tricarboxylic acid cycle. 2020. Pharmacological Research.(IF 7.658) 【客户文献】

Lable free乙酰化蛋白组学联合能量代谢揭示脓毒症所致心肌功能障碍治疗新靶点

2.

Extreme Acetylation of the Cardiac Mitochondrial Proteome Does Not Promote Heart Failure. 2020.Circulation Research. (IF 14.5)

Lable free乙酰化蛋白组学助力揭示心力衰竭非线粒体高度乙酰化导致

3.

Label-Free Quantitative Proteomics of Lysine Acetylome Identifies Substrates of Gcn5 in Magnaporthe oryzae Autophagy and Epigenetic Regulation. 2018. mSystems. (IF 6.496) 【客户文献】

Lable free乙酰化蛋白组学揭示病原菌致病机制

4.

Regulation of UCP1 and Mitochondrial Metabolism in Brown Adipose Tissue by Reversible Succinylation. 2019. Molecular Cell.(IF 17.97)

琥珀酰化修饰助力证实酰化修饰在维持能量代谢稳态调节中的重要作用

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