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蛋白泛素化修饰(Ubiquitination)常伴随泛素-蛋白酶体降解,引起蛋白稳定性变化,参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应,使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸(Lys)侧链上,并常伴随蛋白酶体降解,调控蛋白表达水平变化。发生泛素化修饰的赖氨酸共价连接泛素分子,即两个甘氨酸K-ε-GG残基,使分子量产生114.1 Da的质量偏移。利用质谱可准确测定分子量是否发生114.1Da的质量偏移,从而检测泛素化修饰肽段及位点。 4D-label free泛素化蛋白组学是基于timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行泛素化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
▶ 植物发育与抗逆;
▶ 感染与免疫研究;
▶ 衰老再生及退行性疾病。
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图 |
蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段相对分子质量分布、肽段序列长度分布 |
▶ 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;
▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;
▶ 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;
▶ 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验,拥有丰富的高水平项目文章;
▶ 数据保证——采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠;
▶ 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。
推荐组合产品:蛋白表达水平全面解析:转录组+蛋白组+泛素化组。
Genome-wide identification of U-box genes and protein ubiquitination under PEG-induced drought stress in potato. 2021. Physiologia Plantarum. (IF 4.50) 【客户文献】
Label free泛素化蛋白组学协助研究马铃薯抗干旱胁迫分子机制
Proteomic Analysis of Ubiquitinated Proteins in Rice (Oryza sativa) After Treatment With Pathogen-Associated Molecular Pattern (PAMP) Elicitors. 2019. Frontiers in Plant Science. (IF 5.753) 【客户文献】
Label free泛素化蛋白组学助力水稻防御机制研究
Rewiring of the ubiquitinated proteome determines ageing in C. elegans. 2021. Nature.(IF 49.962)
Label free泛素化蛋白组学发现抗衰老新机制
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