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N-糖基化蛋白质组学

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糖基化是指蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都修饰有糖链。连接于天冬酰胺(Asn)残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在,也是研究最为深入的一种糖基化形式。蛋白质N-糖基化修饰主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用,参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动。 蛋白质经酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,再用N-糖酰胺酶(PNGase)在重水中切除糖链,然后通过LC-MS/MS对糖基化位点进行分析,实现大规模N-糖基化蛋白质定性定量分析。

实验流程



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应用方向


信号转导研究

基因表达调控研究

肿瘤发展机制研究


数据分析

蛋白质鉴定列表层次聚类热图(cluster)COG/KOG分析
肽段鉴定定量列表修饰位点统计绘图GO富集分析
修饰位点鉴定定量列表GO功能富集图KEGG富集分析
肽段保守motif分析列表KEGG通路图蛋白质互作网络分析
GO功能列表保守motif分析互作网络Module分析
KEGG信号通路Mapping表//

参考文献

1.

Quantitative proteomics analysis reveals important roles of N-glycosylation on ER quality control system for development and pathogenesis in Magnaporthe oryzae. 2020. PLoS Pathogens. (IF 6.823) 【客户文献】

Label-free-N糖基化修饰揭示N糖基化修饰参与稻瘟菌致病过程的分子机制

2.

Comparative Analysis of Whey N-Glycoproteins in Human Colostrum and Mature Milk Using Quantitative Glycoproteomics. 2017. J Agric Food Chem. (IF 5.279) 【客户文献】

N-糖基化揭示初乳和成熟乳之间的营养价值

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