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代谢组学—非靶向代谢组学

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非靶代谢plus

合作交流

代谢组描述的是指生物体内源性代谢物质的整体,可以分为非靶向代谢组和靶向代谢组。非靶代谢组一般是基于LC-MS技术对样本中的代谢物同时进行定性和定量分析,与本地自建库和商业标准品数据库同时进行一级、二级信息的匹配来进行物质鉴定。LC-MS方法适合检测大部分代谢物,该技术成熟稳定,是研究代谢变化的主流技术,适用于各种复杂生物样本,一次检测能提供整体全面的代谢组信息。LC-MS比GC-MS的适用范围更广,适合各种复杂生物样本。

实验流程


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送样建议

样本类型

常规送样量

最低送样量

建议生物学重复

血(血清、血浆)

200 μL

100 μL

临床样本:每组≥ 30

动物来源:每组≥ 10

植物来源:每组≥ 3

细胞样本:每组≥ 6

尿液

200 μL

100 μL

动物组织

100 mg

60 mg

细胞

10^7

10^7

细胞上清

1mL

500 μL

细菌或真菌

沉淀湿重≥200 mg

沉淀湿重≥100 mg

发酵液

500 μL

200 μL

其他液体样本:

卵泡液、脑脊液、淋巴液等

200 μL

100 μL

植物组织

400 mg

200 mg

植物种子

200 mg

100 mg

其他特殊样本

请联系我们咨询

 

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 疾病机理机制,组织发育调控机制研究;

▶ 生物标志物,药物机理等。

数据分析

分析类型分析内容
质控TIC、QC等多项
轮廓分析Superclass分类
差异分析单变量统计分析(火山图等)
多维统计分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等
功能分析层次聚类分析
相关性分析
KEGG分析
高级生信分析WGCNA分析
回归分析
趋势聚类分析
机器学习

技术优势

▶ 海量数据库:3万+在线标准品数据库;

▶ 鉴定数目领先:最高定性数量突破2000;

▶ 先进平台:高分辨质谱平台,提供优质数据;

▶ 严格质控:严格的QC系统和谱图匹配标准,保证定性定量结果最优。


以人血清demo数据为例,总定性数目1000+

代谢物类型(HMDB class分类)

鉴定数目

鉴定结果中代表性物质

羧酸及其衍生物

200+

谷氨酸、天冬酰胺、肌酸、琥珀酸、酪氨酸

脂类似物

300+

2-亚油酸甘油、3-羟油酸肉碱

有机杂环化合物

100+

鸟嘌呤、色氨酸、烟酰胺、尿胆素

苯环型化合物

100+

水杨酸、马尿酸

有机氧化合物

80+

乳糖、犬尿氨酸、2’-脱氧-核糖

有机氮化合物

30+

乙酰胆碱、鞘氨醇、三甲胺氮氧化物、胍基丙酸

核苷酸类似物

20+

ADPS-甲基-5'-硫代腺苷

其他

200+


备注:不同项目和样本类型鉴定数目和种类会有所区别,如需获取其他信息请联系我们索取


参考文献

1.

Intranasal Exposure to ZnO Nanoparticles Induces Alterations in Cholinergic Neurotransmission in Rat Brain. Nano Today. 2020.

非靶代谢-大鼠脑组织- ZnO暴露的毒性影响【客户文献】

2.

One-carbon metabolism supports S-Adenosylmethionine and histone methylation to drive inflammatory macrophages. Mol Cell. 2019. 

非靶代谢-小鼠细胞-一碳代谢通过甲基化来调节炎症【客户文献】

3.

Hexosamine biosynthetic pathway promotes the antiviral activity of SAMHD1 by enhancing O-GlcNAc transferase-mediated protein O-GlcNAcylation. Theranostics. 2020. 

非靶代谢-人细胞-增强O-GlcNAc转移酶可促进SAMHD1的抗病毒活性【客户文献】

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