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代谢组—靶向代谢组学

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氨基酸

合作交流

氨基酸类物质是蛋白质的组成单位、重要的能量物质来源和前体物质,也是生命活动最重要的功能物质,参与能量代谢、免疫调控、内分泌调节、信号传导等生物过程,与肿瘤、心血管疾病、代谢性疾病、神经系统疾病等研究密切相关。本方法利用基于LC-MS的靶向代谢组方法对氨基酸类的30多种代谢物进行绝对定量分析。

实验流程



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应用方向

▶ 动植物生理病理

▶ 食品科学、化工等领域

数据分析

分析类型分析内容
质控QC RSD
差异分析单变量统计分析t test
箱线图
功能分析层次聚类分析
KEGG分析
高级生信分析回归分析
趋势聚类分析
机器学习ROC

技术优势

▶ 高特异性和准确性:采用基于LC-MS的金标准MRM技术,精确定性、绝对定量

▶ 先进平台:Sciex Q-Trap质谱,动态线性范围广

▶ 严格质控:内标+外标,标准品人工校对,标曲R2>0.99


检测指标

编号

代谢物名称

Metabolites

1

Glutamate

谷氨酸

2

Glycine

甘氨酸

3

Lysine

赖氨酸

4

Aspartate

天冬氨酸

5

Arginine

精氨酸

6

Serine

丝氨酸

7

Methionine

蛋氨酸

8

Phenylalanine

苯丙氨酸

9

Tyrosine

酪氨酸

10

Leucine

亮氨酸

11

Isoleucine

异亮氨酸

12

Histidine

组氨酸

13

Proline

脯氨酸

14

Valine

缬氨酸

15

Threonine

苏氨酸

16

Alanine/Sarcosine

丙氨酸/肌氨酸

17

Asparagine

天冬酰胺

18

Creatine

肌酸

19

Spermidine

亚精胺

20

Citrulline

瓜氨酸

21

Glutamine

谷氨酰胺

22

Cysteine

半胱氨酸

23

Creatinine

肌酐

24

Tryptophan

色氨酸

25

Putrescine

腐胺

26

Hydroxyproline

羟脯氨酸

27

Ornithine

鸟氨酸

28

Taurine

牛磺酸

29

Cystine

胱氨酸

30

Choline

胆碱

31

Aminoadipic   Acid

氨基己二酸


送样建议

样本类型常规送样量最低送样量
建议生物学重复
血(血清、血浆)≥200 μL≥100 μL

临床样本:每组≥ 30 例

动物来源:每组≥ 10 例

植物来源:每组≥ 3 例

细胞样本:每组≥ 6 例

尿液≥200 μL≥100 μL
动物组织≥100 mg≥60 mg
细胞10^710^7
细胞上清≥1mL≥500 μL
细菌或真菌沉淀湿重≥200 mg沉淀湿重≥100 mg
发酵液≥500 μL≥200 μL
卵泡液、脑脊液、淋巴液等≥200 μL≥100 μL
植物组织≥400 mg≥200 mg
植物种子≥400 mg≥200 mg
其他特殊样本请联系我们咨询

参考文献

1.

Proteomic and Metabolomic Analyses Provide Insights into the Mechanism on Arginine Metabolism Regulated by tRNA Modification Enzymes GidA and MnmE of Streptococcus suis. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2020.

氨基酸靶向检测-猪链球菌-研究GidA-MnmE修饰通路在猪链球菌中的分子作用机制【客户文章】

2.

Cytosolic Malate Dehydrogenase 4 Modulates Cellular Energetics and Storage Reserve Accumulation in Maize Endosperm. Plant Biotechnology Journal. 2020. 

氨基酸靶向检测-玉米胚乳-协助研究玉米胚乳中储存复合物积累的分子机制【客户文章】

3.

Increasing phosphate inhibits cadmium uptake in plants and promotes synthesis of amino acids in grains of rice. Environmental Pollution. 2020.

氨基酸靶向检测-水稻种子-应用磷酸盐可抑制水稻中镉的吸收和增加稻粒中游离氨基酸合成【客户文章】

4.

Alteration of S-adenosylhomocysteine levels affects lignin biosynthesis in switchgrass. Plant Biotechnol J. 2018.

氨基酸靶向检测-柳枝稷-S-腺苷高半胱氨酸影响柳枝稷中木质素合成【客户文章】

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