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代谢组—靶向代谢组学

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能量代谢

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能量代谢维持着生命体最基本的生命活动,比如植物逆境和动物疾病通常伴随着严重的代谢紊乱,且大多归咎于能量代谢紊乱。能量代谢也影响着免疫细胞的功能和命运,与抗病和免疫应答有关。同时,蛋白质磷酸化的修饰基团来自于ATP,所以能量代谢异常可进一步导致上游蛋白质磷酸化通路的改变,严重影响生物体的各项生理、病理功能。本方法利用基于LC-MS的靶向代谢组方法对能量代谢相关的30多种代谢物进行绝对定量分析。

实验流程


image.png



应用方向

▶ 糖代谢和能量代谢相关生理和病理研究




数据分析

分析类型分析内容
质控QC RSD
差异分析单变量统计分析t test
箱线图
功能分析层次聚类分析
KEGG分析
高级生信分析回归分析
趋势聚类分析
机器学习ROC

技术优势

▶ 高特异性、高准确性:采用MRM技术精确定性、绝对定量

▶ 专属kit:高通量检测30多种参与能量代谢通路的代谢物

▶ 严格质控:内标+外标,标准品人工校对,标曲R2>0.99


检测指标:

参与能量代谢通路的关键30多种代谢物,主要集中在TCA循环、糖酵解和氧化磷酸化通路。

编号

代谢物名称

Metabolites

1

3-磷酸甘油酸

3-Phospho-D-glycerate

2

乙酰辅酶A

Acetyl coenzyme A (Acetyl-CoA)

3

三磷酸腺苷

Adenosine 5'-triphosphate (ATP)

4

二磷酸腺苷

ADP

5

α-酮戊二酸

Alpha-Ketoglutarate

6

腺苷酸

AMP

7

果糖-6-磷酸

Beta-D-Fructose 6 phosphate (β-D-F6P)

8

乌头酸

cis-Aconitate

9

环腺苷酸

cyclic-AMP

10

果糖-16-二磷酸

D-Fructose 1,6-biphosphate

11

葡萄糖-6-磷酸

D-Glucose-6-phosphate (G6P)

12

二羟丙酮磷酸

Dihydroxyacetone phosphate (DHAP)

13

黄素单核苷酸

Flavin mononucleotide(FMN)

14

延胡索酸

Fumarate/Fumaric acid

15

鸟苷酸

GMP

16

二磷酸鸟苷

Guanosine 5'-diphosphate (GDP)

17

三磷酸鸟苷

Guanosine -5'-tridiphosphate (GTP)

18

异柠檬酸

Isocitrate

19

乳酸

Lactate

20

苹果酸

L-Malate acid

21

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸

NAD+

22

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸

NADP+

23

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(还原型)

NADPH

24

草酰乙酸

Oxaloacetate

25

磷酸烯醇式丙酮酸

Phosphoenolpyruvate (PEP)

26

丙酮酸

Pyruvate/Pyruvic acid

27

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(还原型)

Reduced nicotinamide adenine   dinucleotide (NADH)

28

琥珀酸

Succinate/Succinic acid

29

琥珀酰辅酶A

Succinyl-CoA

30

硫胺素焦磷酸

Thiamine pyrophosphate (TPP)

31

柠檬酸

citrate

32

戊二酰辅酶A

Glutaryl-CoA


送样建议

样本类型常规送样量最低送样量
建议生物学重复
血(血清、血浆)≥200 μL≥100 μL

临床样本:每组≥ 30 例

动物来源:每组≥ 10 例

植物来源:每组≥ 3 例

细胞样本:每组≥ 6 例

尿液≥200 μL≥100 μL
动物组织≥100 mg≥60 mg
细胞107107
细胞上清≥1mL≥500 μL
细菌或真菌沉淀湿重≥200 mg沉淀湿重≥100 mg
发酵液≥500 μL≥200 μL
卵泡液、脑脊液、淋巴液等≥200 μL≥100 μL
植物组织≥400 mg≥200 mg
植物种子≥200 mg≥100 mg
其他特殊样本请联系我们咨询

参考文献

1.

Cytosolic Malate Dehydrogenase 4 Modulates Cellular Energetics and Storage Reserve Accumulation in Maize Endosperm. Plant Biotechnology Journal. 2020.

能量代谢-玉米胚乳-协助研究玉米胚乳中储存复合物积累的分子机制【客户文章】

2.

Intranasal Exposure to ZnO Nanoparticles Induces Alterations in Cholinergic Neurotransmission in Rat Brain. Nano Today. 2020.

能量代谢-大鼠肝脏血浆-ZnO纳米颗粒引起脑部损伤的机制【客户文章】

3.

Sirt3 is a novel target to treat sepsis induced myocardial dysfunction by acetylated modulation of critical enzymes within cardiac tricarboxylic acid cycle. Pharmacological Research. 2020. 
能量代谢-小鼠心脏-协助研究脓毒症引起的心肌功能障碍的治疗机制【客户文章】

4.

L-lysine potentiates aminoglycosides against Acinetobacter baumannii via regulation of proton motive force and antibiotics uptake. Emerging Microbes and Infections. 2020.

能量代谢-鲍氏不动杆菌菌体- L-赖氨酸增强鲍氏不动杆菌对氨基糖苷类抗生素敏感性的作用机制【客户文章】

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