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翻译后修饰组—修饰蛋白定量分析

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DIA磷酸化蛋白质组学

合作交流

采用IMAC富集策略高效提升S, T, Y磷酸化修饰肽段数量的同时,基于数据非依赖采集(Data-Independent Acquisition,DIA)技术,无偏向性采集质谱扫描范围内所有信号,有效解决磷酸化修饰的定性定量难题,实现低丰度修饰信息采集向“全息扫描”飞跃。

实验流程

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应用方向

推荐实验设计:高深度分析、大样本分析、多组学分析

▶ 细胞信号、激酶信号网络分析

▶ 多浓度梯度、多时间梯度处理

▶ 临床大队列样本分子分型等

▶ 蛋白组+磷酸化组联合分析等;

生物领域各个研究方面,如:

▶ 基础医学、临床诊断:疾病机理机制,大队列疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

修饰肽段鉴定列表差异表达火山图层次聚类热图(cluster)
修饰肽段定量列表修饰位点统计绘图保守motif分析
GO功能注释列表GO功能富集图GO功能有向无环图
KEGG通路注释统计表KEGG富集分析KEGG通路图
KEGG信号通路Mapping表蛋白质互作网络分析互作网络Module分析
亚细胞定位、结构域注释表亚细胞定位分析结构域分析
激酶注释(限人、大、小鼠)激酶修饰表达分析激酶-底物关系分析

技术优势

▶ 高覆盖度——修饰肽段鉴定数量15000+,鉴定水平提升超70%

▶ 高稳定性——重现性提升近一倍

▶ 高准确性——定量准确性接近靶向检测技术

参考文献

1.

Oncogenic Mutations Rewire Signaling Pathways by Switching Protein Recruitment to Phosphotyrosine Sites. Cell. 2019

DIA磷酸化组学揭示肺癌EGFR突变引起酪氨酸磷酸化信号重塑的分子机制

2.

Multi-level proteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV. bioRxiv. 2020

采用DIA蛋白组、DIA磷酸化组、泛素化组、转录组整合揭示新型冠状病毒对宿主的扰动机制


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