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代谢组—靶向代谢组学

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色氨酸

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色氨酸(Trp)是人体必需的氨基酸。色氨酸代谢受肠道微生物直接或间接调节,其代谢产物具有免疫、代谢、神经调节功能,已成为多种疾病的潜在治疗靶点。本方法针对色氨酸3条代谢通路中的23/25种代谢物,利用基于LC-MS的MRM技术对其进行高通量相对或绝对定量分析。

实验流程


image.png


应用方向

▶ 肠道菌群代谢、神经调节、代谢调节研究等领域

数据分析

分析类型分析内容
质控QC RSD
差异分析单变量统计分析t test
箱线图
功能分析层次聚类分析
KEGG分析
高级生信分析回归分析
趋势聚类分析
机器学习ROC

技术优势

▶ 高特异性、高准确性:采用MRM技术精确定性、绝对定量

▶ 专属kit: 三条色氨酸相关通路高度覆盖

▶ 严格质控:内标+外标,标准品人工校对,标曲R2>0.99


检测指标

主要覆盖3条代谢通路的代谢物:芳香烃受体代谢途径(AhRpathway);犬尿氨酸代谢途径(KynureninePathway);血清素代谢途径(Serotonin Pathway)

编号

代谢物名称

Metabolites

1

色氨酸

tryptophan

2

犬尿素

L-kynurenine

3

吡啶甲酸

Picolinic Acid

4

3-羟基邻氨基苯甲酸

3-Hydroxyanthranilic Acid

5

色胺

tryptamine

6

褪黑激素

melatonin

7

黄尿酸

xanthurenate

8

喹啉酸

Quinolinic Acid

9

N-甲酰犬尿氨酸

N-formyl-kynurenine

10

 朱砂酸

cinnavalininate

11

3-羟基犬尿氨酸

3-hydroxyl-L-kynurenine

12

犬尿胺酸

kynurenate

13

3-吲哚基-beta-D-葡糖苷酸

Indoxyl-β-D-glucuronide

14

5-羟基-L-色氨酸

5-hydroxyl-L-Tryptophan

15

血清素

serotonin

16

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸

NAD+

17

吲哚

indole

18

5-羟基吲哚-3-乙酸

5-Hydroxyindole-3-acetic Acid

19

吲哚-3-甲醛

Indole-3-carboxaldehyde

20

3-甲基吲哚

3-methyl-indole

21

吲哚-3-丙酸

Indole-3-propionic acid

22

吲哚-3-乳酸

Indole-3-lactic Acid

23

吲哚乙酸

indoleacetate(IAA)

24

吲哚-3-乙醛

Indole-3-acetaldehyde

25

3-羟基吲哚硫酸盐

3-Indoxyl Sulfate Potassium Salt


送样建议

样本类型常规送样量最低送样量
建议生物学重复
血(血清、血浆)≥200 μL≥100 μL

临床样本:每组≥ 30 例

动物来源:每组≥ 10 例

植物来源:每组≥ 3 例

细胞样本:每组≥ 6 例

尿液≥200 μL≥100 μL
动物组织≥100 mg≥60 mg
细胞10^710^7
细胞上清≥1mL≥500 μL
卵泡液、脑脊液、淋巴液等≥200 μL≥100 μL
粪便≥200 mg≥100 mg
其他特殊样本请联系我们咨询

参考文献

1.

Tryptophan Metabolites Are Associated With Symptoms and Nigral Pathology in Parkinson's Disease. Movement Disorders. 2020.

色氨酸通路-人血浆和脑脊液-犬尿氨酸代谢和神经疾病PD的相关性

2.

Cerebral tryptophan metabolism and outcome of tuberculous meningitis: an observational cohort study. Lancet Infectious Diseases. 2018.

色氨酸通路-人血清-色氨酸通路代谢物和结核性脑膜炎的相关性

3.

Gut Microbiota Regulation of Tryptophan Metabolism in Health and Disease. Cell Host & Microbe. 2018.

色氨酸通路-色氨酸代谢物在疾病和健康状态下的肠道微生物-宿主互作中的作用综述

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