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代谢组—非靶向代谢组学

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植物(次生)代谢组

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次生代谢产物(Secondary metabolites)是不直接涉及到生命正常生长、发育或繁殖的有机化合物,次生代谢产物在植物中起着重要的作用,与抵御病虫害及应对环境胁迫密切相关。次生代谢产物主要包含:生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等。部分次级代谢产物可以作为药物、调味品或药物。本方法利用基于高分辨质谱的LC-MS非靶向代谢组技术,建立了庞大的初级代谢物和次生代谢物的数据库,通过“MS1+MS2+RT”或“MS1+MS2”的方式辅助人工谱图解析对代谢物进行鉴定,助力植物代谢组学研究。

实验流程


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送样建议

样本类型

常规送样量

最低送样量

建议生物学重复

植物组织

≥400 mg

≥200 mg

重复数≥6

水培分泌物

≥10 mL(可自行提前冷冻浓缩)

≥5 mL(可自行提前冷冻浓缩)

其他样本

请另外咨询


备注:根系分泌物等类似样本因为代谢物浓度低,客户可自行取等量体积冻干之后寄送给我们,以便得到更好的实验结果


应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 植物次生代谢物活性成分鉴定

▶ 植物抗病虫害、抗逆研究


数据分析

分析类型分析内容
质控TIC、QC等多项
差异分析单变量统计分析(火山图等)
多维统计分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等
功能分析层次聚类分析
相关性分析
KEGG分析
高级生信分析回归分析
趋势聚类分析

技术优势

▶ 实测定性数目多:均定性数目在800+

▶ 物质种类多:包含生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等众多次级代谢物和初级代谢产物

▶ 鉴定准确:QE高分辨质谱,严格谱图匹配标准(MS1,MS2,RT,人工谱图解析)

▶ 严格质控:多项严格QC系统,保证定性定量结果最优


参考文献

1.

Identification and Mode of Inheritance of Quantitative Trait Loci for Secondary Metabolite Abundance in Tomato. Plant Cell. 2015.

植物次生代谢组-番茄-番茄次生代谢产物和性状位点的鉴定及遗传模式研究

2.

Primary transcript of miR858 encodes regulatory peptide and controls flavonoid biosynthesis and development in Arabidopsis. Nature Plants. 2020.

植物次生代谢组-拟南芥- miR858的初级转录物编码调控肽控制拟南芥类黄酮的合成

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