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4D-DIA定量蛋白质组学

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4D-蛋白质组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪,通过捕集离子淌度(TIMS)与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离(保留时间、质荷比、离子强度)基础上,增加肽段的碰撞截面积(CCS),实现第4维度(离子淌度)的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的新一代DIA技术,通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂(diaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合,具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时,外加第四维离子淌度分离,使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时,降低谱图复杂度和提高离子利用率,实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程


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应用方向

▶ 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

▶ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

▶ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

▶ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选

▶ 各种物种的蛋白质组草图构建

数据分析

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技术优势

▶ 4D技术加持,更加适合微量样本

▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便

▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台,检测速度提升近一倍


推荐组合产品

大样本分型研究优选,大分子专属平台,质量与效率双重保障:4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白质组


参考文献

1.

Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.

4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染机制

2.

diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.

4D-DIA技术原理介绍:diaPASEF

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