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4D-label free 定量蛋白质组学

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4D-label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的非标记蛋白组学技术,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。该技术是对传统label free蛋白质组学的升级,其核心是将数据依赖采集(DDA)与同步累积连续碎裂(PASEF)相结合,外加第四维度的离子淌度分离(基于肽段的碰撞截面积CCS),提高离子利用率和准确度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程



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应用方向

▶ 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

▶ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

▶ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

▶ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选

▶ 各种物种的蛋白质组草图构建

▶适合临床微量样本检测,如:外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等

数据分析

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技术优势

▶ 4D技术加持,更加适合微量样本

▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便

▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台,检测速度提升近一倍


推荐组合产品

组学“黄金”联合:4D-label free + 4D-label free磷酸化蛋白质组


参考文献

Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis. ACS Appl Mater Interfaces. 2021.

4D-Label free蛋白组联合4D磷酸化蛋白组学-人尿液外泌体-前列腺癌患者标志物研究


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