肠道微生物
肠道微生物中蛋白质组与代谢组的应用研究
发布日期:2018.05.04


肠道微生物中蛋白质组与代谢组的应用研究




※ 肠道微生物宏蛋白质组 —— 系统解析肠道微生物功能


宏蛋白质组:基于蛋白质组分析技术,对样本中的大量微生物群体,进行系统性地蛋白质鉴定与定量比较分析,解析不同个体中肠道微生物的蛋白构成与功能差异。



多角度数据分析:

(1) 蛋白水平分析:蛋白质名称与定量比较;蛋白功能与通路注释,功能与通路差异比较。

(2) 物种水平分析:蛋白质的物种归属,物种差异比较分析。

                                                      

       


         


※ 代谢组学 —— 系统考察肠道菌群功能代谢产物的变化


 方案一:非靶代谢组 —— 菌群代谢产物大规模分析

采用液质联用的方法(LC-MS/MS)对生物样本进行无偏向性全扫描分析,旨在尽可能更多的检测到肠道菌群相关代谢产物,系统性考察代谢产物的变化规律。

l   优势:

1)自建数据库:2700种商业化标准品的自主数据库,涵盖氨基酸、糖类、胆汁酸、脂肪酸、吲哚、神经递质、激素、维生素等,确保定性结果可靠度;

(2)严格QC:采用最严格的QC系统,保证每个项目的定量结果达到最优。


 方案二:靶向代谢组 —— 菌群代谢产物特异性检测

针对特定的某类肠道菌群代谢物(如短链脂肪酸类、神经递质类、胆汁酸类等)进行特异性地检测,具有特异性强、灵敏度高、准确性高的特点。



方案三:多组学关联分析—— 挖掘菌群-代谢产物相关性

16S多样性 + 代谢组基于16s基因组与代谢组数据,从菌群和代谢产物共同揭示菌群组成与功能变化。通过生物信息学分析,从多角度深入挖掘菌群-代谢物之间的关联性,筛选引起代谢变化的关键菌群。

   
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