非靶向代谢组 • 小分子全面代谢组(GC+LC)
· 产品定义
气相或液相色谱联用质谱(GC-MS或LC-MS)和核磁共振(NMR)光谱是科学研究中最常用的代谢分析平台,但是使用的单一分析平台还不能够完全检测整个代谢组,这主要是由于这些代谢物的理化性质多样性,如亲水性碳水化合物、挥发性醇和酮、氨基和非氨基有机酸以及疏水性脂类等。GC-MS适合分子量比较小(<700D)、易挥发、热稳定的非极性物质检出,LC-MS适用范围更广,适合如分子量大、热不稳定、极性大等物质检出。对同一份样本分别进行GC-MS和LC-MS检测, 从而可以更全面研究各类型小分子代谢物在样本中的变化情况和内在关系。
· 技术路线
· 技术优势
1. 深度数据库:3万+本地小分子数据库(LC-MS)和1000+本地数据库及公共数据库(GC-MS);
2. 鉴定数目领先:平均项目鉴定代谢物数量2000+;
3. 高质数据:严格的实验质控与高标准的谱图匹配标准及卡值条件;
4. 高品质售后服务:专业项目管理与生信团队保证您在售中与售后的体验。
· 数据分析
服务标准 |
分析类型 |
分析内容 |
拟解决问题 |
标准数据分析 |
质控 |
TIC等多项QC分析 |
获得高质量数据 |
轮廓分析 |
Superclass分类 |
获得代谢物的分类信息 |
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差异分析 |
单变量统计分析(火山图等) |
反映每个变量的组间差异 |
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多维统计分析(PCA、PLS-DA、OPLS-DA等) |
评估组间差异,找到导致组间差异的影响变量 |
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功能分析 |
层次聚类分析 |
获得代谢物的表达模式信息 |
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相关性分析 |
衡量两个变量的相关程度 |
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KEGG分析 |
进一步了解相关代谢通路和生物学功能 |
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高级数据分析 |
生信分析 |
WGCNA |
获得与表型强关联的核心代谢物 |
回归分析 |
建立重要代谢物和其他指标的关联 |
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趋势聚类分析 |
探讨代谢物的含量趋势模式 |
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机器学习 |
筛选诊断性能良好的生物标志物 |
部分数据分析结果展示
· 推荐组合产品
小分子全面代谢组学(GC+LC)+蛋白/转录组:上游(蛋白/转录)+下游(代谢)表明因果
· 推荐应用领域
1. 临床疾病研究
2. 营养功能研究
3. 表型与生理功能研究
4. 植物生理与抗逆研究
5. 药物治疗评价与机制研究
· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)
样本类型 |
常规送样量 |
最少送样量 |
建议生物学重复 |
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细胞类 |
细胞 |
≥2*10∧7/sample |
≥2*10∧7/sample |
临床样本:每组≥ 30 例 动物来源:每组≥ 10 例 细胞样本:每组≥ 6 例 |
粪便 |
粪便、肠道内容物 |
≥300mg/sample |
≥150mg/sample |
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体液类 |
血浆/血清、尿液 |
≥400μl/sample |
≥200μl/sample |
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组织类 |
肝脏、肾脏、癌/癌旁组织等 |
≥300mg/sample |
≥150mg/sample |
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菌体 |
细菌沉淀、真菌沉淀 |
≥400mg/sample |
≥200mg/sample |
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特殊样本 |
精子、分泌物、环境样本等 |
请另外咨询 |
· 参考文献
The gut metabolite indole-3 propionate promotes nerve regeneration and repair. Nature. 2022