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Less is more:DIA技术,2table+1figure,得一篇12分的Molecular Psychiatry文章

2019-02-13
中科新生命
2562

Nature旗下的Molecular Psychiatry(IF=11.64)是精神疾病领域的top期刊。

Molecular Psychiatry

在19年1月发表了一篇题为“Complement pathwaychanges at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in alongitudinal population-based study: evidence for a role of stress”的文章,文中利用了DIA技术,研究补体系统与精神异常的关系。

Molecular Psychiatry发表的文章

Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress

IF=11.64

补体级联是免疫系统的重要组成。越来越多的证据表明,补体系统异常与精神疾病有密切关系。为了进一步证明两者之间的关系,研究者对来自于UK avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC)队列中的血液样本,进行了DIA蛋白质组检测,重点关注其中29个补体级联相关蛋白的表达水平。结果显示,6个蛋白的表达水平与精神异常相关。利用大鼠慢性应激模型,该研究结果进一步表明:慢性应激可能引起补体通路异常,与精神异常有显著相关性。(小编:如果进一步研究一下他们的肠道菌群,可能会有更多的发现)

对于为什么采用DIA技术进行血浆蛋白质组研究,作者在文中给出了说明:DIA技术避免了非靶向蛋白质组学研究中会遇到的许多问题,比如缺失性,原文如下:

作者原文

作者对于文章中图表和结果的展示采取的是“less is more”原则,2 table+1 figure,Results全文也仅有3段话:

 作者原文

1个table和1个figure:列出所检测的几个补体通路相关的表达水平。

 作者原文图表

虽然话少,但作者为保证数据的严谨性,特意在进行数据分析时,剔除了两个样本的信息,原因是因为该样本的色谱信息不好,原文如下:

作者原文

跟本平台一样,对DIA的数据有着严格的质控,色谱的评价是非常重要的,但是却被大家所忽视(中科新生命的DIA数据从3个维度评价色谱表现,并将数据呈现在报告中)。

虽然DIA是个比较新的技术,但凭借着覆盖度、重现性、准确度方面的革新式提升,DIA已经出现在越来越多的高水平研究中。随着2019年的到来,我们一定会看到越来越多DIA技术的应用被报道。

中科新生命不仅是在国内最早推出DIA服务的平台,而且也是仅有的对DIA进行持续深度开发的平台。例如,针对临床最高频研究样本——血浆,我们实现了单个样本、无需去除高丰度蛋白、无需分级、2h时长定量1000+蛋白的分析能力,该突破被大V平台广泛关注和报道(例如Bioart之前的一篇推文蛋白质组学技术新突破:血液样本DIA,定量蛋白数创新高)。后续,同样的技术升级我们也将移植到其他类型样本上,敬请期待。

最后再给要发DIA文章的老师们加一把力:

中科新生命MCP

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