新闻资讯

客户文献 | 首篇梅毒患者血清的非靶代谢组学研究发表!

2019-04-29
中科新生命
7507

关键词:非靶代谢,诊断标志物,梅毒血清,中科新生命

梅毒是世界范围内一种常见的性传播疾病,致病病原体是梅毒螺旋体,2017年,中国疾控中心报告梅毒新发病例47.5860万例,死亡45人,在所有乙类传染病中排名第三位。

今天小编要为各位老师解读一篇APT客户厦门大学附属中山医院杨天赐课题组最近发表的文献,是首篇对梅毒患者进行代谢组学研究的文章,并筛选到了可以用于梅毒诊断的标志物,其中中科新生命提供非靶向代谢组学检测。

梅毒的诊断和发病机制仍是临床研究的难点。目前梅毒的诊断主要依赖血清学检测(包括非密螺旋体和密螺旋体抗体检测),血清学检查的假阴性结果以及该方法的局限性可能阻碍梅毒的及时诊断和治疗,科学家们仍在寻找更敏感、更特异的梅毒诊断标志物。

在本研究首次利用非靶代谢组学方法寻找梅毒患者血清中代谢诊断标志物。

JEADV

Analysis of Serum Metabolite Profiles in Syphilis Patients by Untargeted Metabolomics

2019  IF=4.287

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jdv.15530

研究材料:血清样本,20例梅毒患者,20例健康人

研究结果:

01、质控评价

代谢的个体化差异大,生物学重复数多,且不做混样,因此对仪器稳定性的要求高。通过QC样本的质控评价可以对仪器的稳定性进行评价,从而判断数据质量的好坏。

通过PCA分析,可以看到图中所有的QC样本(蓝色的点)都紧密地聚集在一起,表明实验过程中仪器稳定性良好,数据可靠。 


图1

02、血清代谢组学结果

基于UPLC-Q-TOF/MS技术,总鉴定到2890个特征峰,通过PLS-DA、层次聚类热图分析表明,梅毒患者和健康组在代谢水平上有着明显得分离趋势。

图2

图3

03、筛选潜在生物标志物

满足VIP>1,P<0.05差异筛选标准的显著性差异代谢物有5个,分别是氧化物三甲胺, 精氨酸, 溶血性磷脂酰胆碱, 甜菜碱, 乙酰肉碱。其中梅毒患者的氧化物三甲胺是健康对照组的3.922倍,其可作为梅毒患者与健康者的代谢诊断标志物。

图4

04、通路分析

KEGG通路分析表明,代谢产物主要参与甘油磷脂代谢、胆碱代谢和ABC转运体。

图5

05、结果

本研究首次通过非靶代谢组学,揭示了梅毒患者与健康者在代谢层面存在者明显差异,氧化物三甲胺可作为梅毒患者的诊断标志物。

小编心得

新颖的研究样本和方向或许是这篇文章发表在JCR 2区的原因之一。后期作者一方面可以用大样本队列验证氧化物三甲胺的诊断能力,另一方面也可以从异常的代谢通路出发,结合蛋白组、转录组做更加深入的机制研究。