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“泛素化组”促销震撼来袭——植物创新研究新工具

2019-06-18
中科新生命
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中科新生命

利用泛素化修饰组学,中科新生命助力老师在植物领域的泛素化研究中发表多篇泛素化文章:

1. 客户文献——Nature Genetic:泛素化组揭示水稻抗非生物胁迫机制。

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中科新生命助力中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所林鸿宣课题组,利用泛素化修饰组方法,发现了水稻抗高温和适应环境温度的机制。该研究成功克隆了作物中第一个抗高温的数量性状基因位点QT(OgTT1,编码一个26S 蛋白酶体的α2 亚基)。机理研究发现,非洲稻中该等位基因不仅在转录水平上对高温的响应更有效,而且其编码的蛋白使细胞中的蛋白酶体在高温下对泛素化底物的降解速率更快,从而显著降低水稻细胞中积累的有毒变性蛋白的种类和数量,最终保护了植物细胞。

2. 客户文献——frontiers in Plant Science:泛素化组揭示胁迫信号转导变化。

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中科新生命助力中国农业科学院植物保护研究所刘文德课题组、华中农业大学陈小林副教授课题组,利用泛素化修饰组方法,探究了水稻在遭受生物胁迫时的胁迫信号转导通路变化。

研究团队比较了真菌来源的诱发子(chitin处理)与细菌来源的诱发子(flg22处理)处理水稻的泛素化修饰蛋白变化。在chitin处理的样本中,121个蛋白的144个泛素化位点显示上调变化,162个蛋白中167个泛素化位点显示下调变化。在flg22处理的样本中,118个蛋白的151个泛素化位点显示上调变化,166个蛋白的179个泛素化位点显示下调变化。生物信息学分析表明这些蛋白质具有不同的调节作用,许多蛋白质的泛素化水平响应于激发子处理而显着改变,它们参与泛素化系统,蛋白质转运,配体识别,膜运输和氧化还原反应。值得注意的是,苯丙烷类代谢途径中许多酶的泛素化水平被上调,表明该途径受到水稻PTI泛素化的严格调节。此外,植物激素信号通路中一些关键组分的泛素化水平上调或下调,表明泛素化可以微调激素反应的激素途径。总之,该研究发现了泛素化通过靶向多种蛋白质进行降解或稳定化,从而参与到调节水稻中的PTI反应,大量泛素化靶标将成为了解泛素化系统如何调节防御反应的宝贵资源。

3. 客户文献——Scientific Reports:泛素化表达谱奠定小麦生理功能探究基础。

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中科新生命助力河南农业大学陈锋课题组,利用泛素化修饰组方法,首次鉴定了普通小麦(Triticum aestivum L.)的泛素修饰谱,为后续研究赖氨酸泛素化在小麦中的生理作用研究奠定了基础。

研究团队通过LC-MS/MS分析,发现了小麦幼苗中285个蛋白上发生433个赖氨酸泛素化修饰,修饰肽段保守基序分析找到了水稻种四种保守的泛素化基序。特别的是,285种泛素化蛋白中有83种在水稻(Oryza sativa L.)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)中具有泛素化同源物。此外,预测显示与结合蛋白和具有催化能力的蛋白优先发生泛素化修饰。蛋白质相互作用网络分析显示,蛋白质泛素化调节的各种相互作用;功能和通路分析显示,泛素化蛋白参与了多种生物过程。

4. 客户文献——Journal of proteome research:泛素化表达谱奠定水稻生理功能探究基础。

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中科新生命助力中国农业科学院王国梁课题组,利用泛素化修饰组方法,首次鉴定了水稻(Oryza sativa)的泛素修饰谱,为后续研究赖氨酸泛素化在水稻中的生理作用研究奠定了基础。

研究团队利用高分辨率LC-MS/MS,在水稻叶片中共鉴定了464中蛋白质,861条修饰肽段。对泛素化组的生物信息学分析显示,多种细胞功能、多种亚细胞定位的蛋白均发生泛素化修饰,修饰肽段保守基序分析找到了水稻种七种保守的泛素化基序,此外,预测显示与结合蛋白和具有催化能力的蛋白优先发生泛素化修饰。蛋白互作网络与代谢通路分析显示,水稻种一系列信号转导及代谢相关通路蛋白发生泛素化修饰。该研究显示了修饰蛋白质组学是测定植物中大规模蛋白质修饰变化的有用的手段之一。

泛素化作为植物中一种广泛存在的调控细胞反应的机制,不仅广泛参与到植物的生长发育,而且广泛参与到植物抗非生物胁迫、抗生物胁迫的调控机制中。心动的老师还不行动起来吧!

更多关于泛素化的介绍,可以查看:【修饰专栏】被低估的泛素化一直在骚动

关于中科新生命的泛素化修饰组学服务:

1.APTBIO前身为中科院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心(SIBS),基于国内顶尖的蛋白质组服务平台。

2.业内率先推出修饰组学分析服务,合作文章发表:高水平+数量领先泛素化组代表文章。

3.采用金标抗体(CST)+金标富集操作技术。