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组学大礼包优惠第三弹| 领取代谢顶刊Cell Metab的代谢调控研究模式

2020-05-26
中科新生命
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新陈代谢一直以来都是领域内研究热点。然而,检测到了代谢产物变化之后,我们往往希望继续探究:代谢变化背后的调控机制是什么?本期的“代谢调控专场”,我们为大家带来了组学大礼包第三弹,即代谢调控研究套装——蛋白翻译后修饰组+非靶代谢组。

前两弹回顾

1. 五重组学爆款礼包第一弹:蛋白质组学专场

2. 爆款组学第二弹| CNS新套路:肠道菌群-血液-靶器官,串起来才够味!!

先给各位老师奉上大礼包内容(见下图),然后我们将通过多篇发表于代谢顶刊Cell Metabolism(IF 22)的文献,解锁大礼包背后的创新研究套路。  

解锁“蛋白翻译后修饰+代谢”大礼包之旅

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代谢的调控机制是什么?这一直是代谢深入研究避不开的问题。本年度,代谢顶刊Cell Metabolism推出的15周年纪念特刊中,曾发表了业内多位顶尖科学家对于代谢未来五年发展的洞见。其中,来自美国圣路易斯华盛顿大学的Clay F. Semenkovich教授提到:

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尤其对于代谢疾病,Clay F. Semenkovich教授提到“比如肥胖增加改变了疾病风险的多种潜在介质,这些风险可能影响蛋白的翻译后修饰”。因此,这为我们深入研究代谢物变化提供一个新颖的研究线索——“蛋白质翻译后修饰”。

研究线索一:打通表型与机制的通道

多项研究结果表明,蛋白翻译后修饰(乙酰化、磷酸化等)是代谢调节关键机制,其通过修饰代谢酶、改变其活性,直接调控代谢流量变化,因此“修饰+代谢”是打通表型与机制的高效研究手段。

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研究线索二:多篇Cell Metab背书

近五年研究成果中,多位领域内大牛采用翻译后修饰组挖掘代谢调控及代谢疾病致病机制,可见,“给代谢研究来点修饰感”是一个创新、高分文章的研究套路。

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以Cell Metabolism上的其中一篇经典案例为参考(如下),研究人员为了探究运动能力强与弱的大鼠之间燃料的选择倾向性及背后的调控机制。通过代谢组发现运动能力强伴随更加高效的运动燃料选择(低糖原利用率、低脂肪氧化率、高支链氨基酸利用率),随后采用翻译后修饰蛋白质组学找到了关键调控机制——即运动能力强伴随更强的线粒体蛋白去乙酰化能力,而该能力或是驱动高效燃料选择的原因。


研究线索三:联合生信分析助力关键调控因子挖掘

将修饰蛋白质组与代谢组数据进行整合,我们可以从表达模式比较分析(PCA分析)、到代谢通路整合(KEGG通路联合分析)、到调控关系挖掘(相关性、O2PLS联合分析),分析修饰对代谢调控的整体编号趋势,锁定关键代谢调控通路,层层递进挖掘翻译后修饰对代谢的调控因子。

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中科新生命提供的“修饰+代谢”爆款大礼包,签单即享价格优惠,而且免费赠送联合分析,欢迎有意向的老师前来咨询。

中科新生命客户文章代表

修饰类:

1) Low-Dose Sorafenib Acts as a Mitochondrial Uncoupler and Ameliorates Nonalcoholic Steatohepatitis. Cell Metab. 2020 May 5;31(5):892-908.e11.DIA+磷酸化蛋白质组-协助研究低剂量索拉非尼可作为线粒体解偶联剂改善非酒精性脂肪性肝炎

2) Quantitative Phosphoproteomic and Metabonomic Analyses Reveal GmMYB173 Optimizes Flavonoid Metabolism in Soybean under Salt Stress. Mol Cell Proteomics. 2018 Jun;17(6):1209-1224. 磷酸化蛋白质组+非靶代谢-大豆耐盐胁迫机制

代谢类:

1) First In Vivo Evidence for Compromised Brain Energy Metabolism upon Intranasal Exposure to ZnO Nanoparticles. Environ. Sci. Technol. Lett.2020, 7, 5, 315–322. 非靶代谢+能量代谢研究ZnO纳米颗粒引起的脑部损伤的机制

2)Identification of the urine and serum metabolomics signature of gout. Rheumatology (Oxford). 2020 Mar 5;keaa018. 血清和尿液非靶代谢组发现痛风患者早期诊断biomarker和致病机制