多组学联合新品——复刻高分文章思路,对数据简单堆砌说再见
大部分生理过程是由许多复杂的网络和相互依赖的途径共同推进,帮助生物体进行正常的生长发育、胁迫应激等过程。这个复杂的系统并不是多条独立的线性途径的简单加和,而是涉及到大量的基因表达、蛋白质功能执行和代谢水平的协同改变。针对越来越多的多组学联合研究及分析需求,近期中科新生命全新推出了一款“转录蛋白代谢三组学联合分析”产品——从转录、蛋白到代谢,打通表型与分子机制间的关系,梳理数据逻辑,有机整合分析。复刻高分文章思路,对数据简单堆砌说再见。相比于以往的生信分析产品,这款产品“高分文章复刻”的特色到底体现在哪呢?为了回答这个问题,我们首先对近期一些高分文章进行一次盘点。
#1
Nature Plants
Multi-omics reveals mechanisms of total resistance to extreme illumination of a desert alga
发表时间:2020年
主要结果:
解读详情:
https://mp.weixin.qq.com/s/XphEmjkrQTK9ws1rpKhOmA
#2
Nature Plants
Maize multi-omics reveal roles for autophagic recycling in proteome remodelling and lipid turnover
发表时间:2018年
主要结果:
解读详情:
https://mp.weixin.qq.com/s/D3orA_mIRknfqzF-5kxdUQ
#3
The Plant Cell
Autophagy Plays Prominent Roles in Amino Acid, Nucleotide, and Carbohydrate Metabolism During Fixed-carbon Starvation in Maize
发表时间:2020年
主要结果:
解读详情:
https://mp.weixin.qq.com/s/Kj5RI2R43USBF__zHB_nIw
#4
Plant Physiology
Multi-omics Analysis Reveals Sequential Roles for ABA during Seed Maturation
发表时间:2019年
主要结果:
解读详情:
https://mp.weixin.qq.com/s/bUCbSMgn5ketGyKbwB3HlA
通过盘点以上多篇植物生理方向的高分文献,我们不难发现它们都有着非常类似的研究模式——(1)实验设计——首先选取一种特定的实验材料或应激处理方式(2)表型观察——比较实验设计分组下生理表型的响应和变化(3)代谢组分析——对生理表型进行代谢物分子层面的描述和解释(4)转录组+蛋白质组分析——从基因表达层面描述发生的应激调控(5)整合分析——利用代谢组组具象化表型变化,利用基因表达解释表型变化背后的深层机制,最终阐述特定生理或应激条件下的整体生物系统变化。
在总结了这些高水平研究思路后,我们的报告分析逻辑也随之产生了:
通过该多组学生物信息学报告的剖析和引导,能够帮助老师们从庞大而又复杂的多组学数据中迅速理出线索,充分利用好组学大数据带来的系统生物学信息。此外,本产品正限时免费体验中,相关配套检测产品也正火热促销中,最后一周,有兴趣的老师请抓紧机会咨询。