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一图看懂 | 多组学联合为何需要样本一一对应

2021-05-19
中科新生命
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近期,中科新生命发布了转录蛋白代谢三组学联合新品及大力促销活动。
1.入夏限定套餐
直降1万!三组学关联分析,小样本研究套餐,超高性价比首选转录组+4D定量蛋白质组+非靶代谢(3万+升级数据库)两组六重复简单实验设计,三组学项目套餐仅五万元,尽享最新技术!三组学联合生物信息学分析免费送,复刻高分文章思路,发文直接用!
2.限时特价
超出12个样本, 4166元/样,三组学特惠不停歇!


活动一经发出,收到老师们踊跃地咨询。其中,有一些实验设计上的问题非常具有共性——例如:三个组学应该如何取样?如果做6重复,能否取18个样本,每个组学各分6个样本进行做组学联合? 针对这个问题,一图让您看懂:
在多组学联合分析中,经常会用到相关性分析(简单的如pearson, spearman相关性分析,高级的如O2PLS模型)。这些分析的目的是在统计学角度建立不同组学分子的相互调控关系,原则都是保证样本一一对应,避免组内的个体差异引起结果误差。如上图所示,2组6重复样本,可以看到基因A的表达量与代谢物B的含量具有极高的相关性(R2=0.9996)。然而,假设我们把样本顺序打乱,用同组不同个体的基因表达和代谢物含量去做映射,由于组内个体差异的缘故,基因A和代谢物B就不再具有显著的相关性(R2=0.7227)。
因此,为了获得客观,有效的多组学联合数据,不同组学采样的个体一一对应原则非常重要。如个体样本量不足以满足多种组学检测需求,可以事先进行混样,再平均分配到各个组学进行检测。 好的实验设计是理想实验的基础,可千万不要马虎哦!