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深度空间代谢组学Q&A(二)| 数据处理常见问题

2022-04-29
中科新生命
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各位看官大家好!空间代谢组Q&A又和大家见面啦!上一期,我们介绍了空间代谢组学的工作流程及样本准备小技巧(点击阅读)。这一期,我们将为大家继续解答数据处理中的常见小问题

Q1 深度空间代谢组学如何进行数据处理方式是什么?
深度空间代谢组学的原始数据通过SCILSTM Lab软件处理。SCILSTM Lab是由Bruker公司针对空间代谢组学数据特点而开发的商业化质谱成像分析软件。该软件很好地解决了传统数据处理中,涉及空间和高维代谢组信息整合时,难以准确展现真实分子层面的变化的痛点。目前该软件被广泛使用,堪称分析利器。

Q2 SCILSTM Lab的优势是什么?
1.  内部逻辑稳定,集成完整质谱数据标准化与成像分析功能,输出数据可追溯;
2.  集成下一代机器学习集成算法,支持临床大队列分析比较,多样本/多区域/3D成像整合处理;
3.  高效的谱图解析功能,可实现深度挖掘关键代谢物信息;
4.  可视化操作,数据随时可调,快速交付。

Q3 深度空间代谢组分析是如何进行代谢物定性的?
传统空间代谢组学定性指标有两种,分别是MS1(一级质谱)和MS2(二级质谱)。在新一代空间代谢组学技术中,利用离子淌度捕集装置,针对离子横截面积不同的特点进行分离,形成第三个定性指标CCS值。深度空间代谢组学基于tims-TOF flex MALDI 2开发,可以根据实验需求,结合中科本地标准品数据库以及Bruker商业代谢物数据,实现上述三种指标的定性分析,大幅提升代谢物鉴定准确性。

Q4 深度空间代谢组学数据分析结果示例

关于每种分析具体功能和应用方向,我们会在下一期空间代谢组学Q&A中详细介绍讨论,敬请各位期待~

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