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Olink精准蛋白质组学助力肿瘤生物标志物开发

2022-10-11
中科新生命
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2022年“中国肿瘤标志物学术大会”召开在即。肿瘤标志物的测定,作为肿瘤诊断、监测和治疗的重要手段之一,结合病理活检、影像学等可有效帮助肿瘤患者更好地实现精准治疗。但遗憾的是,现阶段肿瘤标志物的开发仍在持续探索中,低丰度蛋白的检测是其中的一大难题。

癌症登月计划(Cancer Moonshot)旗下的癌症免疫监测和分析中心选择Olink作为低丰度蛋白标志物的核心检测方法,为一系列项目提供细胞因子、趋化因子和生长因子等的检测和分析数据。今天小编来跟大家分享一下Olink蛋白质组学在肿瘤领域的应用,以期能给大家提供一些思路及灵感。

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图片来源链接:https://cimac-network.org/assays/



1. 肿瘤早筛

文献名称Prospective identification of elevated circulating CDCP1 in patients years before onset of lung cancer

期刊Cancer Research(IF 12.701)

检测平台Olink-炎症、mRNA-seq

样本类型:血浆

研究内容:该研究通过olink96-炎症panel检测648个诊断前血液样本,发现肺腺癌早筛标志物CDCP1,又通过mRNA-seq富集分析表明CDCP1在与细胞粘附和迁移相关的通路中具有潜在作用。

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2. 预后分层

文献名称Identification of Potential Prognostic and Predictive Immunological Biomarkers in Patients with Stage I and Stage III Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC): A Prospective Exploratory Study

期刊Cancers(IF 6.575)

检测平台Olink-炎症等

样本类型:血浆

研究内容:该研究采用Olink蛋白质组学发现I期NSCLC阴性预后标志物CD244,III期NSCLC阳性生物标志物CR2、IFNGR2。此外,通过治疗诱导的循环免疫原蛋白表达水平的变化确定CXCL10、IL-10为额外的阴性预测生物标志物。

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3. 药物疗效

文献名称Plasma proteomics identifies Leukemia Inhibitory Factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance

期刊Annals of Oncology(IF 51.769)

检测平台Olink-1536、RNA-seq 等

样本类型:血浆

研究内容:通过Olink蛋白质组学发现,在探索和验证队列中,白血病抑制因子(LIF)基线水平升高与接受ICB治疗的癌症患者较差的临床结局相关,该症状独立于其他预后因素。我们还证明了LIF的循环水平与肿瘤微环境中三级淋巴结构(TLS)的存在呈负相关。

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文献名称In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma

期刊J Immunother Cancer(IF 12.469)

检测平台Olink-免疫肿瘤、质谱

样本类型:血浆

研究内容:利用基于质谱+Olink的全局蛋白质组学分析了24名接受ICI治疗CM患者和24名接受MAPKis治疗CM患者的血浆蛋白组以确定ICI治疗的特异性血浆蛋白水平的变化。结果显示在抗PD-1治疗期间循环PD-1的增加,以及在抗PD-1应答者中呈现多样化的免疫血浆蛋白组学标志。

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4. 肿瘤与其他疾病关联研究

文献名称Inflammatory Leptomeningeal Cytokines Mediate COVID-19 Neurologic Symptoms in Cancer Patients

期刊Cancer cell(IF 38.585)

检测平台Olink-炎症、Olink-神经探索等

样本类型:脑脊液

研究内容:本研究采用Olink蛋白组学分析脑脊液中蛋白质的实时动态变化,发现II型干扰素驱动的柔脑膜炎症细胞因子释放可诱发神经系统损伤。延长型神经炎症伴随的细胞因子释放综合症会导致长期神经认知障碍,这也预示对COVID-19感染引发的神经性并发症治疗需要干预免疫炎症系统。

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Olink作为目前流行的创新蛋白质组学研究方法,其独特的PEA技术大大增加了样本中低丰度蛋白的鉴定深度,辅助肿瘤生物标志物开发,推进肿瘤液体活检的进程。


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