腹水最长8h内运输至实验室展开单细胞实验,2-8℃运输至APT,距离比较远建议上门,PBMC是提取好的细胞悬液,直接进行单细胞实验,或细胞冻存液冻存运输至APT实验室,复苏后评估细胞质量,满足上机要求后可进行单细胞测序实验。
主要看物种和疾病类型,小鼠组织相对成果率高,胰腺样本取出后尽可能洗干净组织表面的酶,有条件可自行采购胰腺组织保护液。甲状腺按照常规组织处理即可。
可能会造成某类细胞凋亡或者某类细胞过表达的情况,这是因为组织离体后细胞解离过程中可能有应激反应,一些病毒细菌感染的细胞在解离过程也会发生快速死亡。老师介意可推荐做空间转录组。
有的,需要的脂肪组织量要多一些,棕色脂肪相比较白色脂肪成功率会高一些,棕色脂肪的转录信息相对丰富一些。最少需要两个黄豆粒大小,人的样本相对容易解离成功,小鼠脂肪抽核容易降解,需要的量也会相对较大。
可以做的,确认客户关注的细胞类型,免疫细胞还是神经类细胞,关注免疫细胞解离单细胞悬液,需要200mg以上样本量
如果关注神经元类细胞建议抽核,样本量至少需要2-3个小鼠海马体大小,为保障实验顺利可多送备选样本。
离心收集类器官样本,放培养基里面常温24h内运输(推荐高铁快运)到APT公司即可。
样本本身为为风险样本, 样本本身细胞量比较少,如果再比较关注中性粒细胞可能细胞量更少甚至没有关注的细胞类型,不建议进行单细胞转录组检测。
可以的,我们已经有椎间盘的项目经验,已经有相关文章见刊,比较困难的点是解离后细胞结团多,细胞数量较少,所以送样量至少400mg来保证单细胞解离的效果。
可以做单细胞测序的,如果老师关注肝实质细胞建议抽核后进行单核转录组,如果老师关注免疫细胞,建议送新鲜组织解离成质量好的单细胞悬液进行后续的实验
有,因为脑组织的固定区域一般较小,需要的组织量比较多,至少1个黄豆粒大小的组织量,小分量解离效果不够理想,神经元细胞活性强体积小的少量被捕获到,如果老师想要得到神经类细胞,可以过70μm的滤网上机,有一定的油包水失败风险,请老师悉知。目前我们有测试过直接上机,目前的上机数据效果还不错,仅供老师参考。