定量蛋白质组 • Label free非标记定量蛋白质组学
· 产品定义
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记定量蛋白质组技术，通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
· 技术路线
· 技术优势
1. 无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短
2. 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
3. 无标记定量蛋白质组学中的倍数压缩
4. 克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便
· 数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图 |
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表达差异分析 |
差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图； |
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多组的比较分析（组别>=3） |
mufzz聚类；雷达图；箱线图 |
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功能分析 |
亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析 |
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质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
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高级数据分析 |
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功能分析 |
GSEA富集分析 |
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临床药物研究 |
药物靶点注释 |
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标志物筛选 |
集成机器学习 |
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与临床表征的联合分析 |
热图；弦图；ROC分析；WGCNA分析 |
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关于个性化数据分析需求，请来电咨询 |
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· 推荐应用领域
生物领域各个研究方面，如：
1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等
3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等
5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等
8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等
· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)
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样品类型 |
推荐样本量 |
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动物组织类 |
常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等） |
15mg-2g |
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植物组织类 |
柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等） |
50mg-2g |
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微生物类 |
菌类 |
20mg-2g |
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细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
0.5-10× 10^7 |
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体液样本 |
血清/血浆 |
0.05ml-1ml |
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外泌体 |
血浆（未提取外泌体） |
2ml（超速离心法） 600μl（Evtrap磁珠法） |
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提取完成的外泌体 |
>15-50μg |
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其他类 |
细胞上清 |
2ml-5ml |
· 参考文献
1. NUPR1 promotes the proliferation and metastasis of oral squamous cell carcinoma cells by activating TFE3-dependent autophagy.2022. Signal Transduction and Targeted Therapy.（IF 18.187）【客户文献】
Labelfree蛋白组学助力揭示自噬在口腔鳞状细胞癌转移中的具体作用机制
2. Fibrillin-1–enriched microenvironment drives endothelial injury and vascular rarefaction in chronic kidney disease. 2021. Science Advances. (IF 14.136) 【客户文献】
Labelfree蛋白质组协助研究FBN1在慢性肾病中引起上皮细胞损伤和血管稀疏的关键作用机制
3.Pyridoxine induces glutathione synthesis via PKM2-mediated Nrf2 transactivation and confers neuroprotection. 2020. Nature Communications. （IF 14.919）【客户文献】
Labelfree蛋白质组揭示星形胶质细胞多巴胺D2受体激活后促进GSH合成具体分子机制
4.Epithelial exosomal contactin-1 promotes monocyte-derived dendritic cells-dominant T cell responses in asthma. 2021. Journal of Allergy and Clinical Immunology. (IF 10.793）【客户文献】
Labelfree蛋白质组助力研究呼吸道上皮细胞来源的外泌体参与哮喘进程的过程机制