定量蛋白质组 • TMT蛋白质组学
· 产品定义
TMT 蛋白质组学(Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术，采用6、10及16种同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，经高分辨质谱仪串联分析，可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量，是标记定量蛋白质组学中的高通量筛选技术。
· 技术路线
· 技术优势
1. 同一批次标记的样本统一处理，减少样本处理及实验误差，实验平行性较高
2. 同一批次标记定量稳定性高
3. 通过分级方法可大大增加蛋白鉴定深度
· 数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图 |
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表达差异分析 |
差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图； |
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多组的比较分析（组别>=3） |
mufzz聚类；雷达图；箱线图 |
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功能分析 |
亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析 |
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质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
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高级数据分析 |
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功能分析 |
GSEA富集分析 |
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临床药物研究 |
药物靶点注释 |
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标志物筛选 |
集成机器学习 |
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与临床表征的联合分析 |
热图；弦图；ROC分析；WGCNA分析 |
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关于个性化数据分析需求，请来电咨询 |
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· 推荐应用领域
生物领域各个研究方面，如：
1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等
3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等
5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等
8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等
· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)
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样品类型 |
推荐样本量 |
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动物组织类 |
常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等） |
30mg-2g |
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植物组织类 |
柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等） |
100mg-2g |
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微生物类 |
菌类 |
50mg-2g |
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细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
1-10× 10^7 |
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体液样本 |
血清/血浆 |
0.1ml-1ml |
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外泌体 |
提取完成的外泌体 |
>100μg |
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其他类 |
细胞上清 |
5ml-10ml |
· 参考文献
1. NLRs guard metabolism to coordinate pattern- and effector-triggered immunity. 2021. Nature（IF 49.962）
利用TMT蛋白质组等揭示水稻广谱抗病性新机制，为抗病育种设计奠定理论基础
2. Construction of heparin-based hydrogel incorporated with Cu5.4O ultrasmall nanozymes for wound healing and inflammation inhibition. 2021. Bioactive Materials.(IF 14.119) 【客户文献】
TMT蛋白组学助力研究一种新型水凝胶材料对炎症抑制和伤口愈合的作用机制
3.Prohibitin 2 deficiency impairs cardiac fatty acid oxidation and causes heart failure. 2020. Cell Death & Disease (IF 8.469)【客户文献】
TMT蛋白组学揭示PHB2缺乏会损害心脏脂肪酸氧化反应并导致心力衰竭
4.KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. （IF 16.016) 【客户文献】
TMT蛋白质组+PRM靶向验证应用于三甲基氯化锡诱导的神经毒性机理研究