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蛋白质修饰鉴定 • 蛋白质修饰鉴定

 

· 产品定义

修饰蛋白质组鉴定通过直接分析修饰基团连接到具体氨基酸上导致的分子质量增加而在质谱检测时造成的质量偏移实现对修饰蛋白质及位点的鉴定。适合于研究者想知道某个蛋白质、蛋白复合体或蛋白互作微环境中是否有某个具体的修饰或者存在着哪些修饰类型,如IPCo-IPPull-Down、蛋白胶条等微量样本。可鉴定的修饰包括磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、O-GlcNac糖基化、乳酸化、巴豆酰化、琥珀酰化、棕榈酰化、戊二酰化、丙酰化、丙二酰化等。

 

· 技术路线

蛋白质修饰鉴定技术路线

        

· 技术优势

1. 可一次性扫描三种常规修饰类型;

2. 分析不局限于常规PTM,可根据确定的氨基酸位点和修饰类型进行个性化靶向修饰分析。

 

· 数据分析

数据分析内容

标准分析

蛋白质鉴定结果

蛋白质GO功能注释分析(仅限UniProt数据库分析)

修饰位点鉴定结果

高级分析

修饰位点氨基酸频率分析

修饰位点二级结构预测

 

· 部分数据分析结果展示

部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等

2. 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等

3. 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等

4. O-GlcNAc糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等

5. 甲基化:染色质结构及转录调控等

6. 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关

7. 乳酸化:表观遗传、肿瘤代谢调控、炎症与免疫调控、心血管疾病

8. 巴豆酰化: 表观遗传、肿瘤代谢调控、DNA损伤修复、生殖发育

9. 棕榈酰化:免疫反应、癌症、代谢、转录、神经生物学和信号等生理过程

 

· 送样建议

常见样本

修饰蛋白质鉴定

IPCo-IPPull-Down蛋白溶液

20ug蛋白质

胶条

明显可见考染或银染条带(银染试剂需与质谱兼容)

 

· 应用案例

       1. Nod factor receptor complex phosphorylates GmGEF2 to stimulate ROP signaling during nodulation.2021. Current Biology.(10.834)

磷酸化位点鉴定——结瘤因子受体复合物磷酸化GmGEF2以刺激结瘤过程中的ROP信号

       2. SIRT1 in the BNST modulates chronic stress-induced anxiety of male mice via FKBP5 and corticotropin-releasing factor signaling. Molecular Psychiatry

乙酰化位点鉴定——BNST中的SIRT1通过FKBP5和促肾上腺皮质激素释放因子信号调节雄性小鼠慢性应激性焦虑

       3. NLRs guard metabolism to coordinate pattern- and effector-triggered immunity. 2021.NatureIF 64.8

泛素化位点鉴定——水稻广谱抗病NLR受体蛋白通过保护免疫代谢通路免受病原菌攻击的机制

       4. O-GlcNAcylation and stablization of SIRT7 promote pancreatic cancer progression by blocking the SIRT7-REGγ interaction. 2022. Cell Death and Differentiation (IF 12.4)

O-GlcNAc糖基化位点鉴定——SIRT7O-GlcNAc糖基化和稳定性通过阻断SIRT7- regγ相互作用促进胰腺癌的进展