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修饰蛋白定量分析 • 乙酰化修饰及其他酰化蛋白质组

 

· 产品定义

蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,通过感应代谢环境变化而变化,同时其常在代谢酶上发生修饰,进而调控代谢通路及代谢酶的活性,参与下游代谢物变化。蛋白质乙酰化(acetylation)是最常见的酰化修饰类型,是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团(如乙酰辅酶A等供体)共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位,其分子质量会相应增加42.01Da,质谱能够准确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。

4D Label free乙酰化蛋白质组是基于布鲁克timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行乙酰化蛋白质组学分析。4D Label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

 

· 技术路线

乙酰化修饰技术路线

产品类型

修饰位点

富集方法

4D Label free乙酰化

Lys

Acetyl-Lysine基序抗体

4D Label free琥珀酰化

Lys

Succinyl-Lysine基序抗体

4D Label free丙酰化

Lys

Propionyl-Lysine基序抗体

4D Label free丙二酰化

Lys

Malonyl-Lysine基序抗体

4D Label free戊二酰化

Lys

Glutaryl-Lysine基序抗体

 

· 技术优势

1. 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;

2. 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;

3. 采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠;

4. 助力客户发表多篇文章

 

· 数据分析

标准数据分析内容

鉴定分析

鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图

表达差异分析

差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图;

功能分析

亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析

功能分析

GSEA富集分析

临床药物研究

药物靶点注释

标志物筛选

集成机器学习

与临床表征的联合分析

ROC分析;WGCNA分析

关于个性化数据分析需求,请来电咨询

 

· 推荐组合产品

打通表型-机制研究:乙酰化组+代谢组。

 

· 推荐应用领域

·   能量代谢调控;

·   代谢综合征研究;

·   真菌细菌研究。

 

· 送样建议

样品类型

推荐送样量

动物组织类

常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等)

75m

植物组织类

柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等)

300mg

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

3×10^7

微生物类

菌类

150mg

 

· 应用案例

       1. HDAC6-dependent deacetylation of AKAP12 dictates its ubiquitination and promotes colon cancer metastasis. 2022. Cancer lettersIF 9.7

乙酰化蛋白质组揭示HDAC6促进结肠癌转移的作用机制

       2. Sirt3 is a novel target to treat sepsis induced myocardial dysfunction by acetylated modulation of critical enzymes within cardiac tricarboxylic acid cycle. 2020. Pharmacological Research (IF 9.3)

乙酰化蛋白质组揭示脓毒症引起的心肌功能障碍的治疗机制

       3. GhHSP24. 7 mediates mitochondrial protein acetylation to regulate stomatal conductance in response to abiotic stress in cotton. 2022. The Crop Journal(IF 4.745)

乙酰化蛋白质组揭示GhHSP2.7介导线粒体蛋白乙酰化调节棉花对非生物胁迫的气孔导度