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非靶向代谢组 • 土壤代谢组

 

· 产品介绍

土壤代谢组学利用基于高分辨质谱的LC-MS/MS技术,对土壤中的小分子代谢物进行无偏向性的检测,和自建标准品数据库以及公共/商业数据库进行MS/MS信息匹配,得到土壤代谢物的定性和定量信息,然后通过统计分析筛选差异代谢物,对差异代谢物进行代谢通路分析,进而寻找土壤代谢物变化对应的生物学意义。

 

· 技术路线

土壤代谢组技术路线

 

· 产品优势

1. 专业的土壤样本前处理方法

2. 高质量自建库 & 高质量公共/商业标准品数据库

3. 高鉴定准确度,严格卡值

 

· 数据分析

服务标准 分析类型 分析内容 拟解决问题
标准数据分析 质控 TIC等多项QC分析 获得高质量数据
轮廓分析 代谢物化学分类归属统计 获得代谢物的分类信息
差异分析 单变量统计分析(火山图等) 反映每个变量的组间差异
多维统计分析(PCA、PLS-DA、OPLS-DA等) 评估组间差异,找到导致组间差异的影响变量
差异倍数分析 直观展示差异代谢差异倍数变化
层次聚类分析 获得代谢物的表达模式信息
相关性分析 衡量两个变量的相关程度
功能分析 KEGG分析 进一步了解相关代谢通路和生物学功能
高级数据分析 生信分析 WGCNA 获得与表型强关联的核心代谢物
与目标参数相关的代谢物筛选 OPLS回归分析
临床指标关联分析 建立重要代谢物和临床指标的关联
分子分型分析 基于代谢物表达趋势分对样本分类
机器学习分析 筛选诊断性能良好的生物标志物
两组学分析 转录组/蛋白组/修饰组+代谢组联合分析
三组学分析 转录组+蛋白组+代谢组联合分析

 

· 部分数据分析结果展示

土壤代谢组部分数据分析结果展示

 

· 推荐组合产品

土壤代谢组+16S/宏基因组  建立代谢产物、微生物、植物之间的关联,解释“因果”

 

· 推荐应用领域

1. 土壤菌落功能

2. 植物环境互作

3. 环境污染/毒理

4. 土壤质量检测评价等

 

· 送样建议

样本类型:土壤(冻干或者非冻干皆可)

送样建议:标准送样量≥2g;生物学重复≥6

 

· 应用案例

       1. Acidification suppresses the natural capacity of soil microbiome to fight pathogenic Fusarium infections. Nat Commun . 2023.

土壤代谢组-土壤-土壤酸化抑制了土壤微生物组对抗致病性镰刀菌感染的能力

       2. Correlations between soil metabolomics and bacterial community structures in the pepper rhizosphere under plastic greenhouse cultivation. Science of the Total Environment. 2020.

土壤代谢组-土壤-塑料大棚种植条件下辣椒根际土壤代谢组学与细菌群落结构的相关性