· 产品定义

空间转录组学（Spatial Transcriptomics）是测量完整组织切片的mRNA，将mRNA的空间信息与形态学内容相结合，并绘制所有基因表达发生的位置，获得生物过程复杂而完整的基因表达图谱。作为一项突破性的技术，它允许科学家们检测组织样本中的所有基因活动，并绘制活动发生的位置。10× Genomics公司的空间转录组产品Visium使用了带有专利涂层的载玻片，每张载玻片可以容纳多个单独的组织切片，并获得空间层面分辨率的RNA测序数据，以更好地进行空间转录组研究。

目前，该解决方案已在人、小鼠及大鼠等多物种、多组织中实现基因表达的空间解析可视化。通过10×官方提供的分析工具可将基因表达数据层加到H&E图像上，用RNA表达和形态学特征来表征组织，从而获得组织切片完整的生物学图谱。

· 技术路线

OCT包埋组织空间转录组技术路线

FFPE组织空间转录组技术路线

· 技术优势

1. 平台稳定，不需要对组织进行细胞解离；

2. 真正的实现组织形态学与转录组学的整合；

3. FFPE兼容，突破从石蜡样本中获取空间基因表达信息的障碍；

4.  组织兼容性强，大部分人、大、小鼠以及部分植物类组织都可适用；

5. 适用与单细胞转录组、空间代谢组等产品相结合，更好的解释生物学问题。

· 数据分析

部分数据分析结果展示

· 推荐组合产品

1.  空间转录组+单细胞转录组；

2.  空间转录组+空间代谢组；

3. 空间转录组+空间蛋白组。

· 推荐应用领域

1. 脑神经学：神经系统疾病研究；

2. 发育生物学：细胞的空间分布和时空变化；

3. 免疫研究：免疫浸润和免疫微环境；

4. 肿瘤研究：肿瘤微环境和肿瘤异质性；

5. 病理学研究：病理切片的空间表达信息。

·  送样建议 (特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)

· 参考文献

1.   Kevin Lebrigand, et al. The spatial landscape of gene expression isoforms in tissue sections. Nucleic Acids Research, 2023.

2.   Thomas Krausgruber, et al. Single-cell and spatial transcriptomics reveal aberrant lymphoid developmental programs driving granuloma formation. Immunity, 2023.