多组学联合分析 • 单细胞多组学
· 产品定义
单细胞组学分析能有效解决bulk组学掩盖的细胞个体差异，发现细胞异质性。单细胞多组学联合包括单细胞转录组以及单细胞多组学测序等，可以更加全面地多维度解析细胞个体的作用及细胞之间的关系，对肿瘤异质性、发育进程、感染免疫、药理药靶等研究提供了大数据支持。
· 技术路线
· 数据分析
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分析方向 |
主要内容 |
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数据质控 |
数据可靠性评价 |
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基因/蛋白质表达展示 |
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细胞聚类及可视化 |
t-SNE/UMAP聚类及可视化 |
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差异分析 |
Cluster特异性表达及功能分析 |
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组间cluster差异及功能分析 |
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拟时序分析 |
拟时序轨迹分析 |
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拟时序基因/蛋白质表达分析 |
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个性化分析 |
细胞通讯分析 |
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细胞周期分析 |
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RNA velocity |
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InferCNV |
· 部分数据分析结果展示
1. 单细胞转录组：
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Cellranger分析结果 |
细胞异质性 |
拟时序分析 |
细胞通讯分析 |
2. 单细胞蛋白质组：
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数据质控 |
蛋白质鉴定数量 |
细胞异质性 |
聚类热图 |
· 应用方向
· 单细胞多组学解决方案
· 送样建议
| 样本类型 | 样本量 | 备注 |
| 组织类 | 200mg-2g | 新鲜组织，不能冻存 |
| 细胞类 | 1-10×106 | 细胞活率>80% |
| PBMC | 1-10×106 | 可直接提供新鲜血液5mL及以上 |
| 稀有细胞类 | / | 如：卵母细胞 |
· 应用案例
1. 通过单细胞测序揭露健康和脂肪肝的细胞通讯图谱
IF 26.00 Landscape of intercellular crosstalk in healthy and NASH liver revealed by single-cell secretome gene analysis
2. 通过单细胞蛋白质组学揭示急性髓性白血病干细胞分化轨迹。
IF 14.919 Quantitative single-cell proteomics as a tool to characterize cellular hierarchies
3. 单细胞转录组+bulk蛋白质组揭示肺衰老机制
IF 14.919 An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics
4. 单细胞转录组+bulk蛋白质组+bulk代谢组揭示肥胖对肿瘤的促进作用
IF 63.40 Obesity Shapes Metabolism in the Tumor Microenvironment to Suppress Anti-TumorImmunity