修饰蛋白定量分析 • 赖氨酸亮氨酰化
· 产品定义
赖氨酸亮氨酰化( lysine leucylation )是一种发生在赖氨酸(K)上的氨基酸化修饰,具体是在ARS(氨基酰-tRNA合成酶)的作用下,将亮氨酸和ATP形成的亮氨酰-腺苷酸中间体中的亮氨酰酰基团连接到蛋白质赖氨酸的氨基上。
赖氨酸亮氨酰化首次于2018年在《Cell Metabolism》上被报道。研究团队发现,亮氨酸可以通过亮氨酸tRNA合成酶(LARS)修饰mTOR复合体的蛋白RagA,在亮氨酸浓度升高的时候激活mTOR;而谷氨酰胺可以通过谷氨酰胺tRNA合成酶修饰并失活调控细胞凋亡的蛋白ASK1,在谷氨酰胺浓度升高的时候抑制细胞凋亡。该研究意味着蛋白的氨基酸化修饰在氨基酸感应、营养依赖性生长信号中具有关键作用。目前有研究报道,升高的母体亮氨酸水平通过亮氨酰化修饰抑制胚胎转录因子TBX5信号传导增加了后代先天性心脏病的风险,表明亮氨酰化在心脏发育过程中具有组织特异性作用,并可能是先天性心脏病的干预靶点。
· 技术路线
使用特异性赖氨酸亮氨酰化基序抗体富集修饰肽段,富集后的肽段使用Astral高端质谱仪进行DIA模式的检测。亮氨酰化修饰导致赖氨酸(K)分子质量会相应增加113.084Da,数据库搜索时,根据分子质量偏移,锁定赖氨酸亮氨酰化修饰肽段及位点。
· 数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
差异表达分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图 |
功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析;GO功能分析、KEGG通路分析;互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、WGCNA分析 |
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· 推荐组合产品
1. 奥斯卡DIA蛋白质组+奥斯卡赖氨酸亮氨酰化蛋白质组
2. 奥斯卡DIA赖氨酸亮氨酰化蛋白质组+奥斯卡DIA酰化类修饰
3. 奥斯卡DIA赖氨酸亮氨酰化蛋白质组+氨基酸靶向代谢组
· 推荐应用领域
1. 生理病理过程中的赖氨酸亮氨酰化分子特征分析
2. 疾病分子机制挖掘
· 送样建议
样本类型 |
推荐送样量 |
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动物组织类 |
常规柔软组织:动物心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺、肠、脑组织等 |
≥100mg |
植物组织类 |
植物根、茎、叶、果实等 |
≥1 g(根和果实适当多送一些) |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥5×10^7 |
微生物类 |
真菌菌体 |
≥1.5 g |
细菌菌体 |
≥200 mg |
· 参考文献
1. He XD, Gong W, Zhang JN, et al. Sensing and Transmitting Intracellular Amino Acid Signals through Reversible Lysine Aminoacylations. Cell Metab. 2018;27(1):151-166.e6. doi:10.1016/j.cmet.2017.10.015
2. Zhang X, Liu L, Chen WC, et al. Gestational Leucylation Suppresses Embryonic T-Box Transcription Factor 5 Signal and Causes Congenital Heart Disease. Adv Sci (Weinh). 2022;9(15):e2201034. doi:10.1002/advs.202201034