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泛修饰蛋白质组学 • 泛修饰蛋白质组学

 

· 产品定义

蛋白质作为生命活动的执行者,其功能核心在于由翻译后修饰调控的“活性状态”。传统修饰蛋白质组学技术受限于单一已知修饰类型的检测,难以满足多修饰分析与未知修饰探索的需求。泛修饰蛋白质组学技术突破这一瓶颈。该技术由郑州大学第一附属医院杨静华教授团队开发,通过深度蛋白质组学结合OpenDelta开放式搜索引擎,无需预设修饰类型,即可在一次检测中无偏鉴定成百上千种已知与未知修饰,实现从有限视野全景解析的跨越,为医学与生命科学研究提供全新视角。

 

· 技术路线

首先提取样品中总蛋白并进行胰酶酶解,随后进行超深度肽段分级和高精度质谱检测。为实现大规模修饰的检测,特别使用开放式搜索引擎OpenDelta对泛修饰进行系统鉴定与定量,获取样本的泛修饰图谱。

 

 

· 数据分析

 

· 推荐组合产品

蛋白表达水平全面解析:转录组+蛋白组+泛素化组。

 

· 推荐应用领域

  1. 发现全新修饰:无偏检测海量修饰,极大提升新修饰及其生物学功能的发现效率。
  2. 疾病机制研究:同步获取蛋白“量”变与修饰“活性”动态,为揭示疾病机制提供多维全景视角。
  3. 药物靶点挖掘:通过对比正常与疾病状态的修饰谱差异,发现传统方法遗漏的、新的潜在治疗靶点。
  4. 生物标志物开发:捕捉疾病演进中早于蛋白丰度改变的动态修饰事件,发现高特异性诊断与分期标志物。

 

· 送样建议

 样品类型

推荐送样量

动物组织类

常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾等)

≥50mg

植物组织类

植物组织(叶片、果实等)

10-50g

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

≥1×10^7

血清

红色促凝管收集的血清

50μL(不去高丰度蛋白)

≥200μL(去TOP2高丰度蛋白)

血浆

EDTA抗凝管收集的血浆

50μL(不去高丰度蛋白)

≥200μL(去TOP2高丰度蛋白)

IP类样本

胶条/蛋白溶液/磁珠

目的蛋白要求在2-5μg左右

 

· 应用案例

       1. Zhai Y, Chen L, Zhao Q, et al. Cysteine carboxyethylation generates neoantigens to induce HLA-restricted autoimmunity. Science. 2023;379(6637):eabg2482.